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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005010`

染色体: Chr01 坐标: 68122695-68125175 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005010`
名称	SmilChr01G005010
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68122695 - 68125175 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005422`
GeneID	`131005422`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005422`
原始查询	`SmilChr01G005010`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES
产物	protein VACUOLELESS GAMETOPHYTES
Arabidopsis	`AT2G16050` (AT2G16050) Cysteine/Histidine-rich C1 domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816102] identity=66.8; qcov=1.02; evalue=1.04e-123; confidence=high
Rice	`Os08g0404500` - identity=37; qcov=1.06; evalue=1.11e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00569 (ZZ); PF03107 (C1_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005422

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788397.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788397.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057788397.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788397.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68123017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C31
`Chr1:68124881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788397.1

242 aa

121

242

C1_2

PF03107 C1_2 9-53 aa PF00569 ZZ 24-53 aa PF03107 C1_2 75-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788397.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	9	53	1.7e-18	67.4	C1 domain
`XP_057788397.1`	Pfam	`PF00569`	ZZ	Domain	24	53	9.5e-06	26.1	Zinc finger, ZZ type
`XP_057788397.1`	Pfam	`PF03107`	C1_2	Domain	75	109	1.7e-18	67.4	C1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932414.1
ATTTTGACAAGACTAGTAAAGCGAAAAATTCCCACCATCACCAATGTTAGCAAGCACAAATACGCATTTTGCTTCAATTTGAAGCCACTAAAAAACCTTAAATCACTTCACCATAAATACATCATCATCATTACAATGCTATGTTAATTTCCTCATAAAAAAAATTAAATATACATACATATATATCCAAGAATTAATTCCCTCCGCCCACACGCGCCGCCATGAAGTACAGCGAAATCTCCCACTTCAGCCACGCTCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005422
ATGAAGTACAGCGAAATCTCCCACTTCAGCCACGCTCACAACCTAAAGTTCGAGTACGCGGAGGCGCCGTTCAAATGCGACGGCTGCAAGGAGGCCGGCATCGGGTCGCGGTACAAGTGCGGCGGCGCGTGCAACTTCGACTTGCACACGCATTGCGCGGTGCCGTCGCCATCCATCAGCCACCCTTTCTACACCAAGTGCGCGTTCCAGTTCATGAGCCGGCCGCCGGGGGCGGTGGCGCGTTACTGCAACGCGTGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788397.1
MKYSEISHFSHAHNLKFEYAEAPFKCDGCKEAGIGSRYKCGGACNFDLHTHCAVPSPSISHPFYTKCAFQFMSRPPGAVARYCNACQKDVAGFVYHCRLCGFDLHPCCAKLPMTIDDGDIKLYLYKKVSAACHRCGRKGRSWSYRSSSKKYNLHVACVKEMLVDSWHEIYYGARDTGSSIKVEGGIPSLRSTLQTHNHKKSSKGKVEKCCEVAGLALQFVISAVLGDPTTLIVALVGNLMSK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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