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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005024`

染色体: Chr01 坐标: 68208685-68212130 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005024`
名称	SmilChr01G005024
描述	cytochrome c biogenesis protein CCS1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68208685 - 68212130 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005363`
GeneID	`131005363`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005363`
原始查询	`SmilChr01G005024`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c biogenesis protein CCS1, chloroplastic
产物	cytochrome c biogenesis protein CCS1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G49380` (AT1G49380) cytochrome c biosis protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841361] identity=77; qcov=0.769; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0769600` (CCS1) - identity=77.5; qcov=0.76; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05140 (ResB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005363

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788277.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057788277.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057788277.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057788277.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788277.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68209255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:68209913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:68209931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:68209947`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:68209975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,B94
`Chr1:68209976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:68210128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,B9
`Chr1:68210842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:68211133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:68211168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B37
`Chr1:68211169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B47,B64,C4,C65,D11
`Chr1:68211729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788277.1

572 aa

286

572

ResB

PF05140 ResB 136-397 aa PF05140 ResB 447-548 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788277.1`	Pfam	`PF05140`	ResB	Family	136	397	2.9e-64	218.3	ResB-like family
`XP_057788277.1`	Pfam	`PF05140`	ResB	Family	447	548	2.9e-64	218.3	ResB-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932294.1
CCCAATAGATAGCCACACACCAAATTTCTTATGGGTTGTGGATAAAGTAGCAACCAACGGCCAACGTGATCGTTGTTACGCCTTTAACATTAACAAAACAGAGAAACAACTCGTATTACCTGTCTCTCTTCACTCCTTCGCAATCCAATGAAGACTCTGAATTCAAGAATCCTATCCAAGATTCAGTTGCAAAACCCAAGAAACGACCTCAAATTCAGAACCCAATTTTCATTTCCCAGCAACTCGCTTCTCTGCAGTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005363
ATGAAGACTCTGAATTCAAGAATCCTATCCAAGATTCAGTTGCAAAACCCAAGAAACGACCTCAAATTCAGAACCCAATTTTCATTTCCCAGCAACTCGCTTCTCTGCAGTTCACGCAGTGTAATAAATGGCGGCACACTCACTCTCACTCTCACTCTCACTCTATATTACGGTAGCAGAAAGACTGTGTTTTCTGAGCTCAGAACCTCTGAGAATAAGAGTACAGCAAAGGGCAAGAAGAAGAGCTCACAAGCGCCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788277.1
MKTLNSRILSKIQLQNPRNDLKFRTQFSFPSNSLLCSSRSVINGGTLTLTLTLTLYYGSRKTVFSELRTSENKSTAKGKKKSSQAPTTTKIEAPEPGRAPAVSGGGPPPPPIKKGRSWKLKGFPKKVLSVLSNLPLAIAEMFAVAGLMALGTFVPQGEAPSFYFEKFPEDNPVLGFFTWRLILALGFDHMFSSPVFLGTLILLGASLMACTYTTQIPLVKVARRWSFLHSADSIRKQEYSDTLPNASVQDLGVILMGAGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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