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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005053`

染色体: Chr01 坐标: 68471368-68474383 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005053`
名称	SmilChr01G005053
描述	uncharacterized SmilChr01G005053
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68471368 - 68474383 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005412`
GeneID	`131005412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005412`
原始查询	`SmilChr01G005053`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PIN domain-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818021]; symbol=MEE21; hit=AT2G34570; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PIN domain-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818021]; symbol=MEE21; hit=AT2G34570; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G34570` (MEE21) PIN domain-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818021] identity=51.2; qcov=0.945; evalue=1.05e-84; confidence=high
Rice	`Os02g0468200` - identity=46; qcov=0.977; evalue=2.54e-66; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF04900 (Fcf1); PF24779 (UTP23_sensor)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788381.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057788381.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.20000	`XP_057788382.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788381.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68473431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C40
`Chr1:68473490`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C40
`Chr1:68473498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:68473783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,C13,D3
`Chr1:68474193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788381.1

283 aa

142

283

Fcf1

UTP23_sensor

PF04900 Fcf1 53-149 aa PF24779 UTP23_sensor 222-240 aa

XP_057788382.1

256 aa

128

256

Fcf1

UTP23_sensor

PF04900 Fcf1 53-149 aa PF24779 UTP23_sensor 222-240 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788381.1`	Pfam	`PF04900`	Fcf1	Domain	53	149	7.1e-29	100.8	Fcf1
`XP_057788381.1`	Pfam	`PF24779`	UTP23_sensor	Motif	222	240	1.6e-06	28.7	UTP23 sensor motif
`XP_057788382.1`	Pfam	`PF04900`	Fcf1	Domain	53	149	5.7e-29	101.1	Fcf1
`XP_057788382.1`	Pfam	`PF24779`	UTP23_sensor	Motif	222	240	1.4e-06	28.8	UTP23 sensor motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932399.1
CAGAAAAGAAAAATCCCCAAACCATCTTCGATCACAGGTTTAGGGTTTTTTTGTAAATCAATCAACAAGTTTTTCAGGGTTTAAGCCCCCAAAATCTGTAAAACCTTCATTCAGTCCTGGTTAGCTCGTCTCAACCCAAATCCTGCCGCGTTCACCAAGCCTTCTTCCTTCACACTTCTCACCGGCGGCAGCAAGAGTTAATAGGCTCAAATGAGGTTTGCCAAGCAAAAGCGGCACCGCAAAGCTGTGCGATTTTTCAC...

XM_057932398.1
CAGAAAAGAAAAATCCCCAAACCATCTTCGATCACAGGTTTAGGGTTTTTTTGTAAATCAATCAACAAGTTTTTCAGGGTTTAAGCCCCCAAAATCTGTAAAACCTTCATTCAGTCCTGGTTAGCTCGTCTCAACCCAAATCCTGCCGCGTTCACCAAGCCTTCTTCCTTCACACTTCTCACCGGCGGCAGCAAGTTAATAGGCTCAAATGAGGTTTGCCAAGCAAAAGCGGCACCGCAAAGCTGTGCGATTTTTCACGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005412
ATGAGGTTTGCCAAGCAAAAGCGGCACCGCAAAGCTGTGCGATTTTTCACGGCTTGCTTCGGATTCCGGGAGCCGTTCAAAATCCTGTGCGACGGGACCTTCGTGCACCATCTTATAGCAAACGGGATTGCCCCCGCTGATACTGCATTGATGAATATCCTTGGCGCCCCCGTCAAACTATTCACTACCAGATGTGCTGTTGCGGAGTTGAAAAGCCTCGGTAGCTCTTACTCTGATTCGGTCGATGCTGCGCGTAGCCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788381.1
MRFAKQKRHRKAVRFFTACFGFREPFKILCDGTFVHHLIANGIAPADTALMNILGAPVKLFTTRCAVAELKSLGSSYSDSVDAARSLMIARCDHENRKSAVACITEVIGEKNTEHFFVATQDAELRKKFQQIPGVPLVYALRNALFLERPSAFQQEFAKAAEEERSRMTDLEWKMLKLKKKRVANDEERDSSETEDQILETLSPRTNVKMTRIDKADKAQVKRKKRAKGPNPLSCKKKQKQGNTDTASEKTRSQGRSQEG...

XP_057788382.1
MRFAKQKRHRKAVRFFTACFGFREPFKILCDGTFVHHLIANGIAPADTALMNILGAPVKLFTTRCAVAELKSLGSSYSDSVDAARSLMIARCDHENRKSAVACITEVIGEKNTEHFFVATQDAELRKKFQQIPGVPLVYALRNALFLERPSAFQQEFAKAAEEERSRMTDLEWKMLKLKKKRVANDEERDSSETEDQILETLSPRTNVKMTRIDKADKAQVKRKKRAKGPNPLSCKKKQKQGNTDTASEKVHLKCI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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