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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005060`

染色体: Chr01 坐标: 68517864-68519444 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005060`
名称	SmilChr01G005060
描述	putative F-box protein At3g10240
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68517864 - 68519444 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005398`
GeneID	`131005398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005398`
原始查询	`SmilChr01G005060`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative F-box protein At3g10240
产物	putative F-box protein At3g10240
Arabidopsis	`AT1G47730` (AT1G47730) F-box and associated interaction domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841184] identity=25.2; qcov=0.892; evalue=5.78e-18; confidence=low
Rice	`Os12g0164300` (OsFbox646) - identity=25.8; qcov=0.924; evalue=5.69e-17; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07734 (FBA_1); PF08268 (FBA_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005398

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788347.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057788347.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788347.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788347.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788347.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68518021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B26,C40,C71
`Chr1:68518066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:68518181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:68518191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr1:68519058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788347.1

369 aa

184

369

FBA_3

FBA_1

PF08268 FBA_3 59-333 aa PF07734 FBA_1 107-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788347.1`	Pfam	`PF08268`	FBA_3	Repeat	59	333	8e-25	88.2	F-box associated beta propeller domain
`XP_057788347.1`	Pfam	`PF07734`	FBA_1	Repeat	107	330	2.1e-18	67.1	F-box associated beta propeller domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932364.1
TTCTGCTTTTTATTCTGGATCTTTGAAATAGCGATCCCAAATGCATTGTTCTTGTCTATATATATACAAGTAAAATTGTTAAAATTTTACCTCACAGGTCTGTCTCATATTGGAGTATATTAAGAAAAAGGTGCGAAAAAATGGAGCCAGATTTGTTCAAATATGTACCATCTGAAATCATGAGCAATATCTTCTCAAGGCTCCATTCCGAAGCAGTTGCAATAAGCAAGTGCGTTTGCAAAGCATGGCTCCATCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005398
ATGGAGCCAGATTTGTTCAAATATGTACCATCTGAAATCATGAGCAATATCTTCTCAAGGCTCCATTCCGAAGCAGTTGCAATAAGCAAGTGCGTTTGCAAAGCATGGCTCCATCTCCTCGAGACTGATTATTTCGTCAACTCCTATCTCTGTAAACCCTCCCTAGCCGTCTTGGCACGCGACTCAACCCGGTTAACAGTTTTCAATCTCAAAGACGAAGACGAAGACGAAGACGGAGTCGATCACGATCACGATCGTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788347.1
MEPDLFKYVPSEIMSNIFSRLHSEAVAISKCVCKAWLHLLETDYFVNSYLCKPSLAVLARDSTRLTVFNLKDEDEDEDGVDHDHDRHYIPVADFDIPQRGAKVKGTSANGLLLVFSKPKSLCICNPLTRDYVELCCPQQSIRASELLCGFGVSKISGRHKVVCMTRSESHCHVYTLGATQTWRTVAKPSGVFCDYAYGVSFGQLVKGNLHWKLWGEAICCFDVETECFSRFSTPPRGGNADLSVLQGCLCACRLAWDKDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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