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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005062`

染色体: Chr01 坐标: 68528920-68531209 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005062`
名称	SmilChr01G005062
描述	factor of DNA methylation 3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68528920 - 68531209 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005432`
GeneID	`131005432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005432`
原始查询	`SmilChr01G005062`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	factor of DNA methylation 3-like
产物	factor of DNA methylation 3-like
Arabidopsis	`AT3G12550` (FDM3) XH/XS domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820435] identity=41.6; qcov=0.638; evalue=4.27e-29; confidence=medium
Rice	`Os02g0293300` (OsFDML1) - identity=48; qcov=0.648; evalue=2.1e-35; confidence=medium
GO	GO:0080188 (gene silencing by siRNA-directed DNA methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03469 (XH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057788412.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057788412.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788412.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788412.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788412.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68529213`	`TGC`	`*`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B35,B5,D10
`Chr1:68529242`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B29,B65,C27,C30
`Chr1:68529242`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B29,B65,C27,C30
`Chr1:68529329`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B117
`Chr1:68529329`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B117
`Chr1:68530274`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A22,B101,B108,B13,B136,B16,B22,B24,B27,B37,B46,B93,C12,C47,C48,C6,C61
`Chr1:68530840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,C6,C61
`Chr1:68530874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B122,B64,C3,C8
`Chr1:68530878`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:68530878`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:68530953`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A19,B122,B134,B42,B43,B99,C26,C31,C46,C53,C67,C80,C86,C87
`Chr1:68530955`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	A5,B108,B23,B55,B79,B84,C23,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788412.1

196 aa

196

PF03469 XH 69-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788412.1`	Pfam	`PF03469`	XH	Domain	69	194	3.2e-43	147.5	XH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932429.1
TTTTTTTAAACAAATATTAATTTTTATATTTTTATTTTTCACACCCTTATTTATTGTTTTCATATTTAAGTGCAACATTAAATAAAGTTAGTTTAATAAAATCAAAGAAAAAAATCAATGTAATTTGTAAATCAAAAGTAATTGTTCCATTTGTTCTATTTTATTAAGTTACACTTTTTTTTATCATGAATATTTGTAAGATATAAACTCTCCTTTACCAGCTAACCAATCTAGATCCGCCACGTGTCCAATTAAATTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005432
ATGAACGGGACGGAGAAAAGGTGCAGAGACACTCATGCAGTGCATCTGAGGCTCTCTCTCCTTCTCTTTCTCTCTCTGCGCAACTCCAAACTTCCTTTCGGAGTGGCGATTTCGCTTTCTGTTTTCCTTCTCTGCGGCGTGTGGCGTCTCCTTATACAGTGGACTGAAGGACCAGTCTGCTCGGGGCAGCATTGGGATCAAGAGAATAATGCATTTTTACCAGCAGCCAAAAGGATGTATATGGATAATGAAACAGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788412.1
MNGTEKRCRDTHAVHLRLSLLLFLSLRNSKLPFGVAISLSVFLLCGVWRLLIQWTEGPVCSGQHWDQENNAFLPAAKRMYMDNETELRAAELCTQWDSRIRDPNWNSFKMIENEHGNGYETILNEEDEELTVVRNELGEEAYEAVTTALMEANEYNPSGRYVVQELWNNKEKRRATLKEGIAYIIKQWRTLKSKRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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