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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005082`

染色体: Chr01 坐标: 68700294-68701229 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005082`
名称	SmilChr01G005082
描述	uncharacterized SmilChr01G005082
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68700294 - 68701229 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012139`
GeneID	`131012139`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012139`
原始查询	`SmilChr01G005082`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=51.8; qcov=0.726; evalue=7.48e-33; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=54.6; qcov=0.772; evalue=1.35e-48; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012139

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796040.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796040.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796040.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796040.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68700299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B12,C58
`Chr1:68700301`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A1,A10,A11,A15,A24,A6,B103,B110,B18,B35,B43,B45,B5,B62,B69,B73,C15,C18,C23,C27,C32,C41,C53,C63,C64,C66,C79,D3
`Chr1:68700359`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	85	A1,A10,A11,A15,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,B102,B103,B105,B107,B109,B110,B113,B120,B123,B126,B131,B133,B136,B18,B26,B27,B35,B38,B42,B45,B5,B50,B52,B55,B58,B62,B63,B64,B66,B69,B71,B73,B74,B82,B83,B85,B91,B97,C10,C15,C18,C21,C22,C23,C27,C28,C3,C31,C32,C41,C44,C45,C47,C48,C53,C54,C55,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C75,C76,C79,C8,C82,C9,D3,D4
`Chr1:68700368`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B52,B55
`Chr1:68700714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:68700740`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B95
`Chr1:68700740`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B95
`Chr1:68700783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:68700825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr1:68700943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:68700948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C30
`Chr1:68700951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796040.1

197 aa

197

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 53-92 aa PF04827 Plant_tran 160-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796040.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	53	92	1.1e-19	70.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057796040.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	160	195	3.5e-05	24.2	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940057.1
ATGGAGGAGGGGCGTATGGACGCACTCGGGGCAAAGCTGGAGCGAAGGAAATGGGTGTATTGCACGGCCCATTTCCTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAATGGTTCATCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGTCGTCGATTTCGCATGAGCCGAGAGTTGTTTCTACGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012139
ATGGAGGAGGGGCGTATGGACGCACTCGGGGCAAAGCTGGAGCGAAGGAAATGGGTGTATTGCACGGCCCATTTCCTGGCAAGTTCATATCGTTTCGATCCACCTCCACCACGCCCGAGGAAGAAGCGGACAATGGTTCATCGTGACCGTGAAGGTGGAGCCGAGCGCCTCCATCGCGATTATTTTTCTGTCGAGCCTGTTTATGGGCCACAATTCTTTCGTCGTCGATTTCGCATGAGCCGAGAGTTGTTTCTACGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796040.1
MEEGRMDALGAKLERRKWVYCTAHFLASSYRFDPPPPRPRKKRTMVHRDREGGAERLHRDYFSVEPVYGPQFFRRRFRMSRELFLRIVNALEVDPYFQQRPDAIGRLSFSPIQKCTAAVRQLAYETAADCCDEYLRIGETTALECLKKFCKAVVRIFGGTYLRRPTTADVQCITAMHEARHGFPGMLGSLDCMKVEM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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