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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005096`

染色体: Chr01 坐标: 68793415-68797220 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005096`
名称	SmilChr01G005096
描述	laccase-11-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68793415 - 68797220 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005364`
GeneID	`131005364`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005364`
原始查询	`SmilChr01G005096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-11-like
产物	laccase-11-like
Arabidopsis	`AT5G03260` (LAC11) laccase 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831887] identity=76.1; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0634500` (OsLAC2) - identity=71.9; qcov=0.94; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005364

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057788278.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788278.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788278.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788278.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788278.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68793544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C19
`Chr1:68793566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr1:68793716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,C80
`Chr1:68793754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B93,C38
`Chr1:68795343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:68795437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:68795949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B109
`Chr1:68795970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:68796055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:68796060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B122,B41,B87,C2,C23
`Chr1:68796066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:68796093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C2,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788278.1

565 aa

282

565

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 37-150 aa PF00394 Cu-oxidase 164-312 aa PF07731 Cu-oxidase_2 411-547 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788278.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	37	150	8.2e-45	152.4	Multicopper oxidase
`XP_057788278.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	164	312	2.9e-47	161.4	Multicopper oxidase
`XP_057788278.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	411	547	1.3e-46	158.5	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932295.1
TTTCACCACTTGTATAAAAATGTGTCAACACATATTCTCCTACAAAAAATAACAAATTAAAAAAGCGAGGTAGCAATGAAGAGAGGAGGCAGCATTTTCAGATGGGCTATTCGTCTGCTTTTCATCTGCCTCGTCTGCATTTCCACTCCGGCCAAAGCTGCACTCAAGAAATATCACTTCAATGTTCAAGTGAAGAATGTGAGTAGGTTGTGCCACGCGAAGCCGATAGTTACCGTAAACGGCATGTATCCGGGGCCGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005364
ATGAAGAGAGGAGGCAGCATTTTCAGATGGGCTATTCGTCTGCTTTTCATCTGCCTCGTCTGCATTTCCACTCCGGCCAAAGCTGCACTCAAGAAATATCACTTCAATGTTCAAGTGAAGAATGTGAGTAGGTTGTGCCACGCGAAGCCGATAGTTACCGTAAACGGCATGTATCCGGGGCCGACGATCTACGTTAGAGAAGGCGATAGGGTTCAGATCAACGTCACCAACCACGCGCAGTACAACATGTCCATCCACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788278.1
MKRGGSIFRWAIRLLFICLVCISTPAKAALKKYHFNVQVKNVSRLCHAKPIVTVNGMYPGPTIYVREGDRVQINVTNHAQYNMSIHWHGLKQYRNGWADGPAYVTQCPVQTGQSYTYDFNVTGQRGTLWWHAHILWLRATVHGAIVIMPKDGTSYPFPQPYQEHNLILGEWWNDDVEEVVKQGNKLGLPPTMSDAHTINGKPGPLFPCSEKYNYAMEVEPGKTYLLRIINAALNDELFFAVAGHNMTVVEIDAVYTKPFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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