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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005099`

染色体: Chr01 坐标: 68806204-68825722 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005099`
名称	SmilChr01G005099
描述	protein RER1A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68806204 - 68825722 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005435`
GeneID	`131005435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005435`
原始查询	`SmilChr01G005099`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RER1A-like
产物	protein RER1A-like
Arabidopsis	`AT4G39220` (ATRER1A) Rer1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830077] identity=69.8; qcov=0.99; evalue=2.42e-99; confidence=high
Rice	`Os01g0106200` - identity=76.8; qcov=0.845; evalue=2.43e-92; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006621 (protein retention in ER lumen); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum)
KEGG	-
Pfam	PF03248 (Rer1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057788416.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057788416.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057788416.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788416.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788416.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68806421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,C18
`Chr1:68806440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B89
`Chr1:68823606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,B84,C36
`Chr1:68823676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A3,B63
`Chr1:68824512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C65
`Chr1:68824581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B103,C15,C21
`Chr1:68824627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B90
`Chr1:68824792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:68824800`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A3,B63
`Chr1:68824806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788416.1

194 aa

194

Rer1

PF03248 Rer1 20-180 aa

XP_057788417.1

194 aa

194

Rer1

PF03248 Rer1 20-180 aa

XP_057788418.1

194 aa

194

Rer1

PF03248 Rer1 20-180 aa

XP_057788419.1

194 aa

194

Rer1

PF03248 Rer1 20-180 aa

XP_057788420.1

194 aa

194

Rer1

PF03248 Rer1 20-180 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788416.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	20	180	2.8e-76	255.7	Rer1 family
`XP_057788417.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	20	180	2.8e-76	255.7	Rer1 family
`XP_057788418.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	20	180	2.8e-76	255.7	Rer1 family
`XP_057788419.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	20	180	2.8e-76	255.7	Rer1 family
`XP_057788420.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	20	180	2.8e-76	255.7	Rer1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095255.1
CCCACACAAGCGTGAAGTCGTTGTTTGTTTTTTCGCGTGGTTTTCGAAGGTGCAATCGAAATCCCTCTCCTCTCTCCAAACAGATCCAAATCTCATATTTTCACCTCCGAAAATCCACCAAGATTTTGTTTCTCTTTCACTGCTGCTTAATCGCGGAAGGGTTTGGGAGTTCATGGAGGGGGTCGGAGGCGATGGTCCCTCAGGAGCAGCTGCAGCACTCGACCAACGGAGGCATGAGTTGTCAAAACTTTTCCAATATT...

XM_057932437.1
TGAAAGGATATTCCCACACAAGCGTGAAGTCGTTGTTTGTTTTTTCGCGTGGTTTTCGAAGGTGCAATCGAAATCCCTCTCCTCTCTCCAAACAGATCCAAATCTCATATTTTCACCTCCGAAAATCCACCAAGATTTTGTTTCTCTTTCACTGCTGCTTAATCGCGGAAGGGTTTGGGAGTTCATGGAGGGGGTCGGAGGCGATGGTCCCTCAGGAGCAGCTGCAGCACTCGACCAACGGAGGCATGAGTTGTCAAAAC...

CDS

5 records

下载 CDS FASTA

LOC131005435
ATGGAGGGGGTCGGAGGCGATGGTCCCTCAGGAGCAGCTGCAGCACTCGACCAACGGAGGCATGAGTTGTCAAAACTTTTCCAATATTATCTAGATAAATCTACTCCACATGCTCATTATCGTTGGATTGGAACTTTTGGTTTGGTGCTTCTTTATGCTCTGCGGGTTTATTATGTTCAAGGATTCTACATTGTCACCTATGGTTTGGGGATCTACCTTCTCAATTTGCTCATCGGGTTCTTGTCGCCTCTTGTTGACCC...

Protein

5 records

下载 Protein FASTA

XP_057788416.1
MEGVGGDGPSGAAAALDQRRHELSKLFQYYLDKSTPHAHYRWIGTFGLVLLYALRVYYVQGFYIVTYGLGIYLLNLLIGFLSPLVDPELEPTEGPSLPTKGSDEFKPFIRRLPEFKFWYAITKAFCVAFVMTFFSMFDVPVFWPILLCYWLVLLFLTMKRQIMHMVKYRYIPFNLGKQKYGKKKPSSSASSPRD

XP_057788417.1
MEGVGGDGPSGAAAALDQRRHELSKLFQYYLDKSTPHAHYRWIGTFGLVLLYALRVYYVQGFYIVTYGLGIYLLNLLIGFLSPLVDPELEPTEGPSLPTKGSDEFKPFIRRLPEFKFWYAITKAFCVAFVMTFFSMFDVPVFWPILLCYWLVLLFLTMKRQIMHMVKYRYIPFNLGKQKYGKKKPSSSASSPRD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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