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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005100`

染色体: Chr01 坐标: 68808004-68810220 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005100`
名称	SmilChr01G005100
描述	protein RER1A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68808004 - 68810220 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017185`
GeneID	`131017185`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017185`
原始查询	`SmilChr01G005100`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RER1A-like
产物	protein RER1A-like
Arabidopsis	`AT4G39220` (ATRER1A) Rer1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830077] identity=68.4; qcov=0.978; evalue=3.6e-62; confidence=high
Rice	`Os06g0708300` - identity=68.2; qcov=0.949; evalue=1.77e-58; confidence=high
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0006621 (protein retention in ER lumen); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum)
KEGG	-
Pfam	PF03248 (Rer1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017185

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057801905.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057801905.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057801905.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801905.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801905.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68808316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,B5,C18
`Chr1:68809072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	B106,B137,B139,B18,B19,B21,B44,B50,B53,B6,B63,B7,B86,B95,C15,C20,C24,C26,C31,C42,C60,C80,D11,D9
`Chr1:68809131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B16
`Chr1:68809137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:68809160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:68809176`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	54	A1,A16,A18,A20,A21,A22,B106,B120,B122,B125,B134,B137,B139,B15,B28,B31,B34,B38,B39,B53,B57,B58,B66,B73,B9,B91,B98,C1,C16,C18,C21,C22,C28,C30,C32,C41,C43,C44,C46,C53,C55,C56,C57,C59,C67,C75,C79,C84,C86,C87,C9,D3,D6,D7
`Chr1:68809179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:68809209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr1:68809215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B25,B5,C18
`Chr1:68809244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B2
`Chr1:68809286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C14
`Chr1:68809412`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C36,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801905.1

136 aa

136

Rer1

PF03248 Rer1 20-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801905.1`	Pfam	`PF03248`	Rer1	Family	20	131	8.7e-45	153.3	Rer1 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945922.1
TCTCCAAACAGATCCAAATCTCATATTTTCACCTCCGAAAATCCACCAAGATTTCGTTTCTCTTTCACTGTTGCTTAATCGCGGAAGATGGACTAGGTTTTTGCGAGCACGAACCGTTTGTTGGGTTTGGGAGTTCATGGAGGGGGTCGGAGGCGATGGTCCCTCAGGAGCAGCTGCAGCACTCGACCAACGGAGGCATGAGTTGTCAAAACTTTTCCAATATTATCTAGATAAATCTACTCCACATGCTCATTATCGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017185
ATGGAGGGGGTCGGAGGCGATGGTCCCTCAGGAGCAGCTGCAGCACTCGACCAACGGAGGCATGAGTTGTCAAAACTTTTCCAATATTATCTAGATAAATCTACTCCACATGCTCATTATCGTTGGATTGGAACTTTTGGTTTGGTGCTTCTTTATGCTCTGCGGGTTTATTATGTTCAAGGATTCTACATTATCACCTATGGTTTGGGGATCTACCTTCTCAATTTGCTCATCGGGTTCTTGTCGCCTCTTGTTGACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801905.1
MEGVGGDGPSGAAAALDQRRHELSKLFQYYLDKSTPHAHYRWIGTFGLVLLYALRVYYVQGFYIITYGLGIYLLNLLIGFLSPLVDPELEPTEGPSLPTKGSDEFKPFIRRLTEFKFWYAITKAFCVAFVIVRSGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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