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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005106`

染色体: Chr01 坐标: 68852857-68853840 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005106`
名称	SmilChr01G005106
描述	very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase PASTICCINO 2A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	68852857 - 68853840 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005427`
GeneID	`131005427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005427`
原始查询	`SmilChr01G005106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase PASTICCINO 2A
产物	very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase PASTICCINO 2A
Arabidopsis	`AT5G10480` (PAS2) Protein-tyrosine phosphatase-like, PTPLA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830912] identity=70.9; qcov=0.991; evalue=7.47e-114; confidence=high
Rice	`Os04g0271200` (OsPAS2) - identity=70.8; qcov=0.955; evalue=1.71e-111; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0018812 (3-hydroxyacyl-CoA dehydratase activity); GO:0030148 (sphingolipid biosynthetic process); GO:0030497 (fatty acid elongation); GO:0042761 (very long-chain fatty acid biosynthetic process)
KEGG	smil00062 (Fatty acid elongation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01040 (Biosynthesis of unsaturated fatty acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04387 (PTPLA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057788405.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057788405.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788405.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788405.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788405.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:68853200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:68853437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:68853483`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B39
`Chr1:68853483`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B39
`Chr1:68853680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788405.1

222 aa

111

222

PTPLA

PF04387 PTPLA 55-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788405.1`	Pfam	`PF04387`	PTPLA	Family	55	218	4.3e-60	202.7	Protein tyrosine phosphatase-like protein, PTPLA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932422.1
TTAAAAAAAAAAAGAAAATAAAAGGGTAGTTGTATCCGCCAACCTAAGCTCCTTAACTCCCCCTCCAAACTTACATAAAATATTTTTGTTTTTTATGTGTATTTAAAAAAGCCTCTATTAAAACTAGGCATTTCCAAATTGGTCATATTCAACAATTCCCAAATCCAATTCCCTCAACCTCGGAATCCACGGCGCCGATGGCCGGAATATCCTCCGCCGTGCGGCGAATCTACCTCACCGTCTACAATTGGACGCTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005427
ATGGCCGGAATATCCTCCGCCGTGCGGCGAATCTACCTCACCGTCTACAATTGGACGCTCTTCTTCGGCTGGCTCCAGGTGTTCTACCTCGCCCTCGCCACTCTCCGGCGGTCCGGCCACGAATCCGTCTACGCCGCCGTCGAGAAGCCGCTCATCCTCGCGCAGTCCGCCGCGCTGCTCGAGATCCTCCACAGCCTCGCCGGAATCGTCAGATCTCCGGTCACCGCCACTCTGCCGCAGGTCGCCTCCCGGCTGTACGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788405.1
MAGISSAVRRIYLTVYNWTLFFGWLQVFYLALATLRRSGHESVYAAVEKPLILAQSAALLEILHSLAGIVRSPVTATLPQVASRLYVTWGILYSFPEIRTHFFVSSLVISWSITEIIRYSFFGLKEAFGSAPSWMLWLRYSTFLMLYPTGITSEVGLIYYALPYLKENGGKFSIRMPNRWNFSFDYYCNALLVLAFYVPGSPHLYGYMLEQRKKALSKAKTA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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