Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr01G005116

染色体: Chr01 坐标: 68947743-68949016 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr01G005116
名称SmilChr01G005116
描述phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH3-like
染色体 / SeqIDChr01 / NC_080387.1
坐标与链方向68947743 - 68949016 / +

ID 对照

NCBI Gene IDLOC131012163
GeneID131012163
locus_tag-
NCBI NameLOC131012163
原始查询SmilChr01G005116

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH3-like
产物phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein SFH3-like
ArabidopsisAT2G21540 (SFH3)
SEC14-like 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816693]
identity=60.8; qcov=1; evalue=1.42e-30; confidence=medium
RiceOs10g0122600 (OsSNDP1)
-
identity=59; qcov=0.856; evalue=8.94e-27; confidence=medium
GO-
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:131012163

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057796068.1
2 Nucleus 细胞核 0.00000 XP_057796068.1
3 Chromosome 染色体 0.00000 XP_057796068.1
4 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057796068.1
5 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057796068.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057940085.1
CACACACTCGACGGCCTTCCTACAACAACTCTTTCTCTCTCAAGGAAGGAGACCTGTGAAAGAAATTTCTGTTGCTGTCTAACTTGATCAAGCTTGTGAGCTGCAATCGAGATGTCGGGACATTTAGATCGCCCCTCGGATCAAAGCCCCGAGAAGAATGATGTGGATAATCTTGATGATGAGAAGAAAACTAGGATCGGGTCCCTCAAGAAGGCGGCAATCACTGCCTCTAACAAGTTTAGGGACTCAATTTCTAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC131012163
ATGTCGGGACATTTAGATCGCCCCTCGGATCAAAGCCCCGAGAAGAATGATGTGGATAATCTTGATGATGAGAAGAAAACTAGGATCGGGTCCCTCAAGAAGGCGGCAATCACTGCCTCTAACAAGTTTAGGGACTCAATTTCTAGAAGGGGCAGGCGGAGCAGCAGAGTCATGTCCGTTGTGCTCGAGGACGAGCATGATGCTGAGGAGGCGCAGTCCGTGGATGCATTTCGCCAGGCGCTTATTCTAGAGGAGTTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057796068.1
MSGHLDRPSDQSPEKNDVDNLDDEKKTRIGSLKKAAITASNKFRDSISRRGRRSSRVMSVVLEDEHDAEEAQSVDAFRQALILEELLPAKHDDFHML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器