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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005133`

染色体: Chr01 坐标: 69131839-69133403 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005133`
名称	SmilChr01G005133
描述	uncharacterized SmilChr01G005133
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69131839 - 69133403 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005442`
GeneID	`131005442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005442`
原始查询	`SmilChr01G005133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0493300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0493300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G04710` (TPR10) ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819629] identity=35.4; qcov=0.856; evalue=1.18e-15; confidence=low
Rice	`Os02g0493300` - identity=36.8; qcov=0.886; evalue=1.49e-18; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00023 (Ank); PF12796 (Ank_2); PF13606 (Ank_3); PF13637 (Ank_4); PF13857 (Ank_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788427.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788428.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788427.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788427.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788427.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69132242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788427.1

162 aa

162

Ank_2

Ank_3

Ank

Ank_4

Ank

Ank_4

Ank_5

Ank_2

Ank

Ank_3

Ank_4

Ank

Ank_3

PF12796 Ank_2 17-79 aa PF13606 Ank_3 21-46 aa PF00023 Ank 21-51 aa PF13637 Ank_4 25-75 aa PF00023 Ank 55-79 aa PF13637 Ank_4 67-108 aa PF13857 Ank_5 74-127 aa PF12796 Ank_2 84-145 aa PF00023 Ank 88-113 aa PF13606 Ank_3 88-113 aa PF13637 Ank_4 92-140 aa PF00023 Ank 122-146 aa PF13606 Ank_3 122-146 aa

XP_057788428.1

132 aa

132

Ank_4

Ank

Ank_4

Ank_5

Ank_2

Ank

Ank_3

Ank

Ank_3

PF13637 Ank_4 2-45 aa PF00023 Ank 25-49 aa PF13637 Ank_4 41-78 aa PF13857 Ank_5 44-97 aa PF12796 Ank_2 54-116 aa PF00023 Ank 58-83 aa PF13606 Ank_3 58-83 aa PF00023 Ank 92-116 aa PF13606 Ank_3 92-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	17	79	7.2e-26	91.3	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	21	46	3.8e-22	76.4	Ankyrin repeat
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	21	51	3.7e-27	93.6	Ankyrin repeat
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	25	75	6.3e-25	87.4	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	55	79	3.7e-27	93.6	Ankyrin repeat
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	67	108	6.3e-25	87.4	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF13857`	Ank_5	Repeat	74	127	6.8e-13	49.4	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	84	145	7.2e-26	91.3	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	88	113	3.7e-27	93.6	Ankyrin repeat
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	88	113	3.8e-22	76.4	Ankyrin repeat
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	92	140	6.3e-25	87.4	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	122	146	3.7e-27	93.6	Ankyrin repeat
`XP_057788427.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	122	146	3.8e-22	76.4	Ankyrin repeat
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	2	45	6.5e-18	65.1	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	25	49	3.8e-22	77.8	Ankyrin repeat
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF13637`	Ank_4	Repeat	41	78	6.5e-18	65.1	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF13857`	Ank_5	Repeat	44	97	4.9e-11	43.4	Ankyrin repeats (many copies)
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	54	116	1.7e-20	74.1	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	58	83	3.8e-22	77.8	Ankyrin repeat
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	58	83	5.1e-17	60.7	Ankyrin repeat
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF00023`	Ank	Repeat	92	116	3.8e-22	77.8	Ankyrin repeat
`XP_057788428.1`	Pfam	`PF13606`	Ank_3	Repeat	92	116	5.1e-17	60.7	Ankyrin repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932444.1
CTCCCAACCATAACCGTCTAAATCACACAATTTACAAATCTCTCTGATCACATCTCTCAAACTCAAGCACCCTCCCTCTGGAAACTGCCGCCGCCGCCGCCTCCTCCGGCCAACGACGCCTCTCGCCCCCTCTTAAACTTTCTCCTTCCCTCTCTTACTCTCTTCTCACAGAACACGCCCACACACGAACAACCTACGCCGCCGCCCAGACTCCGGCGACTTCGCCGACCGCCACTGCCGCGGTCACCACCACCACAGCC...

XM_057932445.1
TCCCAACCATAACCGTCTAAATCACACAATTTACAAATCTCTCTGATCACATCTCTCAAACTCAAGCACCCTCCCTCTGGAAACTGCCGCCGCCGCCGCCTCCTCCGGCCAACGACGCCTCTCGCCCCCTCTTAAACTTTCTCCTTCCCTCTCTTACTCTCTTCTCACAGAACACGCCCACACACGAACAACCTACGCCGCCGCCCAGACTCCGGCGACTTCGCCGACCGCCACTGCCGCGGTCACCACCACCACAGCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005442
ATGTGTGTTTGGGCATCTGAATTTAAGAATGAAAATCATGTGAGAGGTGACTTCGCTACAGGCCGGAGAGCCTTGCACTACGCGGCTGAAATGGGAAATTTGGTGATTTGCGAAATCTTGATTGACAAGTTCGGAGCCTTTGTTGATATCCCGTCTTACAGCGGGGATACTCCTCTGCTAGAAGCTGCCAAAGGGGAACATGTTAAAGTTGTGGAATATCTGATCAACCATAATGCTCTACATCAGGTGCCGAATAAAAA...

LOC131005442
ATGGGAAATTTGGTGATTTGCGAAATCTTGATTGACAAGTTCGGAGCCTTTGTTGATATCCCGTCTTACAGCGGGGATACTCCTCTGCTAGAAGCTGCCAAAGGGGAACATGTTAAAGTTGTGGAATATCTGATCAACCATAATGCTCTACATCAGGTGCCGAATAAAAAGGGATTCACCGCGTTGCATTATGCAGTTCTAAAAGGGAACAAGCAGCTTATGGAGATCTTGCTGGCAAACGGTGCTCCTACGGAGATAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788427.1
MCVWASEFKNENHVRGDFATGRRALHYAAEMGNLVICEILIDKFGAFVDIPSYSGDTPLLEAAKGEHVKVVEYLINHNALHQVPNKKGFTALHYAVLKGNKQLMEILLANGAPTEIDSVDGTPLQIAASLGNLKAVKLLLRNGAAVGNLIKFSCANFVISSL

XP_057788428.1
MGNLVICEILIDKFGAFVDIPSYSGDTPLLEAAKGEHVKVVEYLINHNALHQVPNKKGFTALHYAVLKGNKQLMEILLANGAPTEIDSVDGTPLQIAASLGNLKAVKLLLRNGAAVGNLIKFSCANFVISSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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