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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005135`

染色体: Chr01 坐标: 69141539-69146711 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005135`
名称	SmilChr01G005135
描述	uncharacterized SmilChr01G005135
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69141539 - 69146711 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005380`
GeneID	`131005380`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005380`
原始查询	`SmilChr01G005135`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816138]; symbol=AT2G16405; hit=AT2G16405; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816138]; symbol=AT2G16405; hit=AT2G16405; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G16405` (AT2G16405) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816138] identity=68; qcov=0.967; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0776400` (OsWD40-25) - identity=63; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:1990841 (promoter-specific chromatin binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005380

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057788310.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057788310.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.60000	`XP_057788310.1`
4	Cilium	纤毛	0.40000	`XP_057788310.1`
5	Centrosome	中心体	0.20000	`XP_057788310.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69141800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:69141819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C25,D10
`Chr1:69141832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:69142870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B85,C41,D3
`Chr1:69143107`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B62,D9
`Chr1:69143304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B62,D9
`Chr1:69143391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B135,B62,D9
`Chr1:69143601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr1:69143760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B62,D9
`Chr1:69144524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B62,D9
`Chr1:69144560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:69144628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788310.1

485 aa

242

485

WD40

PF00400 WD40 210-246 aa PF00400 WD40 444-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788310.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	210	246	7.6e-26	90.1	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788310.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	444	479	7.6e-26	90.1	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932327.1
AAAAATAAAACTGAAATTTAGAACTCAATTGAACTTATTATCCACGAATCTCAAGTCAATAGATTCAGTTTTGCAGCTATCTCGAAACTTGTTCGTCGCCATAGAGATCACAGCTCCGATCTAAAACCAAACACTGAATTTACGTGTTCACCCTGCATTTCGTAGTGTGTTAAACAGCAAATTGCTGAAGAGGAGTTTGGATTGAGTTCAATTCGCAATGGCCGATCCAACGGTCGGCGGCATCTCGACGGAAGGGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005380
ATGGCCGATCCAACGGTCGGCGGCATCTCGACGGAAGGGGAGAAGACGAAATCGGAAAATGGTGAAAAGGGAAAAGGAGATTTGGATCCGGAGTTTTTGAGTTGTTTGCTTCAGCCTTCGCCGCCCGATTCCGATCCTAATTACATCGGAATCCGCCGCCTCCTCCTCCACCGGAAGGCGCAGGCCGACCAGCTCAATCGCAAGGGCTGGAAATGTAATGAAAGAGGTTATGTGGCATACCGTAATTTCATTAATAGGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788310.1
MADPTVGGISTEGEKTKSENGEKGKGDLDPEFLSCLLQPSPPDSDPNYIGIRRLLLHRKAQADQLNRKGWKCNERGYVAYRNFINRPRNWESNQTPSLSSTPGQSGRWIQSPSPLFPFYDADSWSTGRDLRSSSRRLSCSTSLSSITSETEHPRKKVEPAYSFVGMHCIFDQSKAMVTVIKFGNMSSDLLAYGSADGSLTVCTVSMPPSVLQQLTGHTKDVTDFDFSANNQYIASASIDKTVRVWDISKGLCIRVIYGVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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