当前解析结果
SmilChr01G005140| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005140 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005140 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005140 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 69174227 - 69175474 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131005472 |
|---|---|
| GeneID | 131005472 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005472 |
| 原始查询 | SmilChr01G005140 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005472 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057788452.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057788452.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788452.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788452.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057788452.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:69174345 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B8,C55,C72 |
Chr1:69174358 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B8,C54,C55,C72 |
Chr1:69174361 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | C54,C55,C72 |
Chr1:69174414 |
TTG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A16,B18,B33,B41,C30,C54,C55,C63,C72,C80,D1 |
Chr1:69174420 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A16,B18,B33,B41,C30,C54,C55,C63,C72,C80,D1 |
Chr1:69174425 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,B8 |
Chr1:69174442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A7 |
Chr1:69174443 |
AGG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C80 |
Chr1:69174443 |
AGG |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | C80 |
Chr1:69174456 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B127 |
Chr1:69174469 |
A |
ACC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 13 | A16,B18,B33,B39,B41,B95,C30,C54,C55,C63,C72,C80,D1 |
Chr1:69174532 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A2,B124,C14 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。