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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005143`

染色体: Chr01 坐标: 69223702-69225549 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005143`
名称	SmilChr01G005143
描述	protein SHI RELATED SEQUENCE 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69223702 - 69225549 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005476`
GeneID	`131005476`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005476`
原始查询	`SmilChr01G005143`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SHI RELATED SEQUENCE 1
产物	protein SHI RELATED SEQUENCE 1
Arabidopsis	`AT5G66350` (SHI) Lateral root primordium (LRP) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836767] identity=52.1; qcov=0.805; evalue=4.46e-50; confidence=medium
Rice	`Os01g0954500` - identity=40.4; qcov=0.871; evalue=1.42e-38; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF05142 (DUF702)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005476

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788455.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788455.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788455.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788455.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788455.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69224177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C48
`Chr1:69224192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr1:69224342`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B27
`Chr1:69224342`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B27
`Chr1:69225092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B46,C30,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788455.1

210 aa

105

210

DUF702

PF05142 DUF702 19-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788455.1`	Pfam	`PF05142`	DUF702	Family	19	153	2.4e-53	181.4	Domain of unknown function (DUF702)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932472.1
CAAAGTAGCATGGTACACTTAAGCAGTGAACTCAAACTCACCAAGAAGAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAGCAAGAAAAAGCTAAGTATAAAGTTGCATCTCAAACTCCAACCTGAAAAGAAGCCCTATTTTTTCTTGAAAATGGATGGATCATTTCTTGTCTGAGGAAAGCCAGAAACCCTTTCCATTTCCCCAACCCTTTTATTTTTCAAAGTAATTTTGTTTTAGCGAGATGATCAGAAGCTATAGATCAAGAAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005476
ATGATGAGGAGAGAAGAGATAGGCGTGATAAATAGCTCGTCGTCGTCTTCGAGCAGCAGGTGCCAAGACTGCGGGAACCAAGCGAAAAAAGACTGCGAGCATTCGAGGTGTCGAACCTGCTGCAAGAGCCGCGGCCTCCAGTGCCCTACCCACGTGAAGAGCACGTGGGTTCCCGTGGCGCAGCGCCGCCCCCGCCACAATGTGATGCAGCAGCACCACCAGATTTCCGCCACCGTCGAGCAGCTCTACCACGGCCCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788455.1
MMRREEIGVINSSSSSSSSRCQDCGNQAKKDCEHSRCRTCCKSRGLQCPTHVKSTWVPVAQRRPRHNVMQQHHQISATVEQLYHGPNPKRYRENRAALGLEEGDFPGEVCFPAIFRCVRVSSVDNVVDSYAYQTSVNISGHLFTGFLYDQGPSELEGTGNYVTGGSSSAAIGFLQQPHFLNSTSAAATGTTPSPYPSSFCAFTSTSSQFF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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