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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005150`

染色体: Chr01 坐标: 69266267-69272616 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005150`
名称	SmilChr01G005150
描述	protein IQ-DOMAIN 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69266267 - 69272616 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005482`
GeneID	`131005482`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005482`
原始查询	`SmilChr01G005150`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 2-like
产物	protein IQ-DOMAIN 2-like
Arabidopsis	`AT5G03040` (iqd2) IQ-domain 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831696] identity=51.1; qcov=1.02; evalue=2.32e-146; confidence=high
Rice	`Os05g0123200` - identity=54.4; qcov=0.992; evalue=3.15e-141; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ); PF13178 (DUF4005)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005482

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057788465.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057788465.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057788465.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057788465.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69269019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:69269032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:69269046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:69269134`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:69269369`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:69269435`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr1:69269533`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B37
`Chr1:69269534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:69269551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,D1
`Chr1:69269575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B46,B87,C30,D6
`Chr1:69270054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B37
`Chr1:69270471`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788465.1

482 aa

241

482

DUF4005

PF00612 IQ 119-137 aa PF13178 DUF4005 391-458 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788465.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	119	137	2.6e-06	27.5	IQ calmodulin-binding motif
`XP_057788465.1`	Pfam	`PF13178`	DUF4005	Family	391	458	3.8e-06	28.1	Protein of unknown function (DUF4005)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932482.1
AAGATTCATTTTTTTTTTTTAAAGTCATCACCTAAAGAAGAAAAAGAAAAAGGAAATACTTATCAAATAAAAATACAGATAGTATATTAAACAAAGAGGTGGGACCCACGTGGGCAGCTCGAGGAGAGAGTGGGGGCCCACATAAGCAAAACCAGCTGTGAAGTTTGTGATTCTCTCTCTCATGTTCTCTCCTCTCCTACTCCCCTTGAATTCTTCCTCGCTCATGGCCAAGATCTGGTTCTCGCTGTCCTTCATCACAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005482
ATGGGTAGAAAAGGAAATTGGTTGTCTTCAGTTAAGAAGGCTTTCAGCCCAAATTCAAAGAAATCAAAGAGAGCCCAAAAGTCGAATAACATACCATTCGAGAATGAAAAGCCAGTAGTTGCTGCTGAATCTCCCAAGCCGGAGGCTGTTGAAGAATCTCATCCTCACCCTCTTCCGCCTTTGGAGGATGTTAAGTTGGAGGAGGTGGAAGATGAGCAGACGAAACATGCTTACTCCGTTGCAGTTGCTTCGGCTGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788465.1
MGRKGNWLSSVKKAFSPNSKKSKRAQKSNNIPFENEKPVVAAESPKPEAVEESHPHPLPPLEDVKLEEVEDEQTKHAYSVAVASAAAAEAAVAAAQAAAEVVRLTTVSQYAGKSAEEVAAIKIQTAFRGYLARRALRALRGLVRLKSLVDGPTVKRQTGNTLKCMQTLSRVQSQIQSRRLRMLEENRALQRQLLQKRAKELESLRMGEEWDDSLQSKEQIEANMLHKYEAAMRRERALAYSYTHQQTWKKSARSPNLLFM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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