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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005166`

染色体: Chr01 坐标: 69431560-69432940 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005166`
名称	SmilChr01G005166
描述	probable carboxylesterase 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69431560 - 69432940 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005497`
GeneID	`131005497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005497`
原始查询	`SmilChr01G005166`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable carboxylesterase 2
产物	probable carboxylesterase 2
Arabidopsis	`AT1G47480` (AT1G47480) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841155] identity=44.6; qcov=0.984; evalue=3.63e-89; confidence=medium
Rice	`Os09g0462100` - identity=43.8; qcov=1.04; evalue=1.36e-82; confidence=medium
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00135 (COesterase); PF07859 (Abhydrolase_3); PF20434 (BD-FAE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788484.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788484.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057788484.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788484.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788484.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69431944`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:69431944`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:69432126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B13,C23,C48
`Chr1:69432255`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B112
`Chr1:69432255`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B112
`Chr1:69432256`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B112
`Chr1:69432256`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B112
`Chr1:69432313`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B118
`Chr1:69432313`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B118
`Chr1:69432342`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C21,C30
`Chr1:69432512`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D6
`Chr1:69432512`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788484.1

310 aa

155

310

COesterase

BD-FAE

Abhydrolase_3

PF00135 COesterase 54-166 aa PF20434 BD-FAE 58-170 aa PF07859 Abhydrolase_3 73-287 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788484.1`	Pfam	`PF00135`	COesterase	Domain	54	166	2.5e-10	40.7	Carboxylesterase family
`XP_057788484.1`	Pfam	`PF20434`	BD-FAE	Domain	58	170	1.6e-12	48.1	BD-FAE
`XP_057788484.1`	Pfam	`PF07859`	Abhydrolase_3	Domain	73	287	9.9e-45	153.6	alpha/beta hydrolase fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932501.1
GAAGGACGAATTTGTTTTGTAGCATTTAAATCGACAATGCAAGTCTCCAATGATGAATGGTACATCTAAACATTGCATGCTAGACTTCAGTATGTAAATATCTAGATTTTTAGGATTCAAATCTTAGCCCTCATCCTTTTCCAAATAAAAGGAATCTTGAATTCATTTCATTGGAGCCTTAAAATAGCATAAAAACGACGAAGTGTCACTACTAGAGCAACAAGCCAAACAAGCAGTGTCTCAAATTTTCTAGGGCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005497
ATGGCCAACGAAATGCTCCACGACTTCTTCCCTTTCGTAAGAGTCTACACAAATGGCCGAATCGAAAGGCTAATGGGCCAAGACACCGTTCCCCCGTCGTCTCTCGATCCAGCCACGGGGGTTCAATCCAAAGACGTCGACATCGCGCCGGAGATCAACCTCTCCGCCCGCATTTACCTGCCGCCCAACGCCCACCGGAGCAAAAAGCTCCCGCTTCTCGTCTACTACCACGGCGGCGGCTTCGTCATCGAATCCGCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788484.1
MANEMLHDFFPFVRVYTNGRIERLMGQDTVPPSSLDPATGVQSKDVDIAPEINLSARIYLPPNAHRSKKLPLLVYYHGGGFVIESAFSAQYQKHLNHLVAQANVVAVSVNYRLAPEFPLPIAFEDSWRALKWSAEGKEEWIEEFADLSRVYLGGDSAGANIAHNMAMRVGSENPEGFNLRGIFLNCPFFGGVDPIGSETTEQSKRGREFSERLLRFVWPGLRDCDEAWVNPGKDPKISGLGCGKVLVYVAEKDFLKERGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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