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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005171`

染色体: Chr01 坐标: 69473519-69474244 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005171`
名称	SmilChr01G005171
描述	30S ribosomal protein S31, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69473519 - 69474244 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005509`
GeneID	`131005509`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005509`
原始查询	`SmilChr01G005171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S31, mitochondrial
产物	30S ribosomal protein S31%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G21290` (AT2G21290) 30S ribosomal protein S31 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816668] identity=60.2; qcov=1.08; evalue=8.61e-25; confidence=medium
Rice	`Os09g0528100` - identity=85.7; qcov=0.615; evalue=6.12e-32; confidence=medium
GO	GO:0005840 (ribosome); GO:0009536 (plastid); GO:0032544 (plastid translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF17067 (RPS31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005509

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057788501.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057788501.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788501.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788501.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69473877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:69473946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,C52
`Chr1:69473970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:69473972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:69473977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr1:69474006`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B36,B72,C65,D8
`Chr1:69474029`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B47,D1
`Chr1:69474029`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B47,D1
`Chr1:69474034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788501.1

91 aa

RPS31

PF17067 RPS31 24-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788501.1`	Pfam	`PF17067`	RPS31	Family	24	83	8.9e-12	45.8	Ribosomal protein S31e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932518.1
GGTGCAAAATGTAAAATGTTAAATTTACACGGCCCTTCGCCTAAATACTTAAAAACTCTGGATCAATCAATCCGGCAAAACTCGGTAATCCAGCTCCACATCTCTCTAGGGTTTAAGACCTGAAAATTTCCACCGAGAAATCAGTTCGATCGGAGGCAGAAATGGCGATGATCCAGCGGTGCAACGCGGCATTGCGGCGGATGGCATCGGCCGCTGAGCTGCGGATGGCATTCTCCTCCCTCGCGTCGTCCATGGCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005509
ATGGCGATGATCCAGCGGTGCAACGCGGCATTGCGGCGGATGGCATCGGCCGCTGAGCTGCGGATGGCATTCTCCTCCCTCGCGTCGTCCATGGCGGCGCCGCCGGGGGATGCGATATTGTGCGGCCGAGGAGACAAGAAGACTAAGAAAGGAAAGAGATTCAAAGGTTCGTTCGGAAACTCCAGGCCTAAAAGGGAGAAGAAAATCGAGAGGATCAAGGATAAGGTAGAGGTGCCGAGGTCCACTCCTTGGCCTCTCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788501.1
MAMIQRCNAALRRMASAAELRMAFSSLASSMAAPPGDAILCGRGDKKTKKGKRFKGSFGNSRPKREKKIERIKDKVEVPRSTPWPLPFKLI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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