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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005183`

染色体: Chr01 坐标: 69542061-69544483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005183`
名称	SmilChr01G005183
描述	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69542061 - 69544483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005520`
GeneID	`131005520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005520`
原始查询	`SmilChr01G005183`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit
产物	V-type proton ATPase 16 kDa proteolipid subunit
Arabidopsis	`AT1G19910` (AVA-P2) ATPase, F0/V0 complex, subunit C protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838579] identity=98.2; qcov=1; evalue=1.63e-111; confidence=high
Rice	`Os12g0168900` - identity=98.2; qcov=1; evalue=6.34e-111; confidence=high
GO	GO:0033179 (proton-transporting V-type ATPase, V0 domain); GO:0046961 (proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism); GO:1902600 (proton transmembrane transport)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04142 (Lysosome biogenesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04145 (Phagocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00137 (ATP-synt_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057788512.1`
2	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057788512.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057788512.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.60000	`XP_057788512.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.60000	`XP_057788512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69542380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:69542756`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	A9,B10,B110,B119,B120,B42,C27,C51,C68,D10,D5
`Chr1:69542810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:69542872`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C59
`Chr1:69542872`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C59
`Chr1:69542875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:69544081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A11,B50,B78,C61,C78
`Chr1:69544081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B50,B78,C61,C78
`Chr1:69544124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B46
`Chr1:69544145`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	118	A1,A10,A13,A14,A19,A21,A25,A5,A6,B1,B10,B100,B102,B106,B107,B108,B112,B113,B114,B118,B120,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B132,B134,B135,B138,B14,B16,B2,B26,B28,B29,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B50,B52,B53,B54,B58,B69,B7,B70,B71,B72,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B90,B91,B96,B98,B99,C1,C11,C12,C14,C15,C17,C19,C20,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C45,C47,C48,C53,C54,C57,C59,C6,C61,C64,C66,C67,C68,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C80,C82,C84,C87,D3,D4,D6,D8
`Chr1:69544149`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	118	A1,A10,A13,A14,A19,A21,A25,A5,A6,B1,B10,B100,B102,B106,B107,B108,B112,B113,B114,B118,B120,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B132,B134,B135,B138,B14,B16,B2,B26,B28,B29,B33,B34,B35,B36,B37,B39,B4,B50,B52,B53,B54,B58,B60,B69,B7,B70,B71,B72,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B90,B91,B96,B98,B99,C1,C11,C12,C14,C15,C17,C19,C20,C22,C23,C24,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C47,C48,C53,C54,C57,C59,C6,C61,C64,C66,C67,C68,C71,C73,C74,C75,C77,C78,C80,C82,C84,C87,D3,D4,D6,D8
`Chr1:69544199`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B130,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788512.1

165 aa

165

ATP-synt_C

PF00137 ATP-synt_C 17-76 aa PF00137 ATP-synt_C 97-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788512.1`	Pfam	`PF00137`	ATP-synt_C	Domain	17	76	4.4e-34	117.2	ATP synthase subunit C
`XP_057788512.1`	Pfam	`PF00137`	ATP-synt_C	Domain	97	155	4.4e-34	117.2	ATP synthase subunit C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932529.1
TTTCATCATATTCGTCCATTTTTATTGGATAATTTCCCTGTATTAATCAATCAATCATGAATTGATCCTCATTATTTATTAATTTAAAATCATCGACGAATTATATTTTGGCATAAATTAAATAGAACTCATTATTTATTAATTTAAAATCATCGACGAATTATATTTTGGCATAAATTAAAATAGAACTCATTATTATCTCCCTCTCGCTCTCGCTCACAGAAGCAGATCCAAAATCCAAACCCCTGCAGAAATTGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005520
ATGTCGTCGACCTTCAGCGGCGATGAAACTGCCCCCTTCTTCGGCTTTCTCGGCGCCGCCGCCGCGCTCGTCTTCTCCTGTATGGGCGCGGCTTACGGAACAGCGAAGAGTGGAGTTGGCGTGGCGTCGATGGGGGTGATGCGGCCGGAGCTGGTAATGAAATCGATTGTGCCGGTGGTTATGGCTGGTGTTTTGGGTATATATGGATTGATTATTGCTGTGATTATCAGCACCGGGATTAACCCTAAGGCTAAGTCTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788512.1
MSSTFSGDETAPFFGFLGAAAALVFSCMGAAYGTAKSGVGVASMGVMRPELVMKSIVPVVMAGVLGIYGLIIAVIISTGINPKAKSYYLFDGYAHLSSGLACGLAGLAAGMAIGIVGDAGVRANAQQPKLFVGMILILIFAEALALYGLIVGIILSSRAGQSRAD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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