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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005196`

染色体: Chr01 坐标: 69646200-69646694 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005196`
名称	SmilChr01G005196
描述	auxin-induced protein 10A5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69646200 - 69646694 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012280`
GeneID	`131012280`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012280`
原始查询	`SmilChr01G005196`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-induced protein 10A5-like
产物	auxin-induced protein 10A5-like
Arabidopsis	`AT2G21210` (AT2G21210) SAUR-like auxin-responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816658] identity=51.9; qcov=0.659; evalue=5.16e-33; confidence=medium
Rice	`Os08g0118500` (OsSAUR31) - identity=61.4; qcov=0.348; evalue=9.46e-19; confidence=low
GO	GO:0009733 (response to auxin)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02519 (Auxin_inducible)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012280

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796186.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057796186.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796186.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796186.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796186.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69646220`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:69646230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C65
`Chr1:69646257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr1:69646267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B140,B36,B93
`Chr1:69646286`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B122,C5
`Chr1:69646286`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B122,C5
`Chr1:69646329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B124,B32,B9,C37
`Chr1:69646449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:69646457`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B90,B92,C26,C31
`Chr1:69646657`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	A22
`Chr1:69646657`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	A22
`Chr1:69646683`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B10,B32,B82,C37,C41

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796186.1

164 aa

164

Auxin_inducible

PF02519 Auxin_inducible 62-157 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796186.1`	Pfam	`PF02519`	Auxin_inducible	Domain	62	157	4.6e-23	82.0	Auxin responsive protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940203.1
ATGAAGACCCCTCCAGATTATCAGGCATCAAGCTCTCAGTCTCCAAACTCCAACAAGTATTTGTTTTCTATATATAGCAAGCTTCAAAACTTAAAGATGCAACACTTGAGCAAGAATCTCATAGTGATAAAAGAATCAGAGACCTCTGGTTTCAACTTTCCTCACCTTTCTCCAAAACAAAAATCCATGGCTATTCGTTGGGTGTCGTTGATATCGAATACTAAGCAGTTCTTCAGGCTCCAATCGCGTCTCCATAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012280
ATGAAGACCCCTCCAGATTATCAGGCATCAAGCTCTCAGTCTCCAAACTCCAACAAGTATTTGTTTTCTATATATAGCAAGCTTCAAAACTTAAAGATGCAACACTTGAGCAAGAATCTCATAGTGATAAAAGAATCAGAGACCTCTGGTTTCAACTTTCCTCACCTTTCTCCAAAACAAAAATCCATGGCTATTCGTTGGGTGTCGTTGATATCGAATACTAAGCAGTTCTTCAGGCTCCAATCGCGTCTCCATAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796186.1
MKTPPDYQASSSQSPNSNKYLFSIYSKLQNLKMQHLSKNLIVIKESETSGFNFPHLSPKQKSMAIRWVSLISNTKQFFRLQSRLHRNQTDVPKGHLAVYVGDIQKKRYVVPISHLNHPSFQGLLHRAEEEFGFNHPTGGLMIPCSENAFLELTSTIQIHHARNQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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