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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005211`

染色体: Chr01 坐标: 69738297-69738806 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005211`
名称	SmilChr01G005211
描述	auxin-induced protein 15A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69738297 - 69738806 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005546`
GeneID	`131005546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005546`
原始查询	`SmilChr01G005211`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-induced protein 15A-like
产物	auxin-induced protein 15A-like
Arabidopsis	`AT4G34800` (AT4G34800) SAUR-like auxin-responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28720205] identity=60.7; qcov=1.01; evalue=5.7e-33; confidence=medium
Rice	`Os08g0118500` (OsSAUR31) - identity=59.7; qcov=0.761; evalue=1.78e-18; confidence=low
GO	GO:0009733 (response to auxin)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02519 (Auxin_inducible)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788541.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788541.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057788541.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788541.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69738590`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	73	A1,A14,A19,A2,A3,B1,B100,B107,B114,B121,B124,B126,B127,B128,B134,B136,B14,B20,B29,B30,B34,B42,B43,B44,B46,B48,B51,B53,B59,B60,B61,B64,B65,B68,B7,B71,B76,B77,B79,B8,B88,B97,B98,C10,C11,C13,C26,C27,C29,C31,C32,C36,C37,C42,C45,C48,C53,C54,C6,C61,C62,C63,C68,C69,C71,C73,C74,C78,C84,C87,D2,D5,D8
`Chr1:69738594`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	73	A1,A14,A19,A2,A3,B1,B100,B107,B114,B121,B124,B126,B127,B128,B134,B136,B14,B20,B29,B30,B34,B42,B43,B44,B46,B48,B51,B53,B59,B60,B61,B64,B65,B68,B7,B71,B76,B77,B79,B8,B88,B97,B98,C10,C11,C13,C26,C27,C29,C31,C32,C36,C37,C42,C45,C48,C53,C54,C6,C61,C62,C63,C68,C69,C71,C73,C74,C78,C84,C87,D2,D5,D8
`Chr1:69738666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B63,C15,C21,D11
`Chr1:69738674`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788541.1

88 aa

Auxin_inducible

PF02519 Auxin_inducible 9-85 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788541.1`	Pfam	`PF02519`	Auxin_inducible	Domain	9	85	2.8e-23	82.6	Auxin responsive protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932558.1
CTACATATTTCCATACCACAGCCATCAACAAGTTTCTCAAAATTCTCTAGCTTTTCACTTTTGATTTGTGTCACAAGAAATCTATTTGTTTTACTTCAAAAAAGACTTCTATTTATACAGCAATGGCCATTCGCCAGATGCTGAGACGATCTTTATCAAGCGAAAGAAGGTCAACTGAAGTTCCAAAAGGGCATGTTGCCGTCTATGTTGGGGAGGATGAAAAGAAGCGTTTTGTGATTCCAGTATCATACTTGAACCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005546
ATGGCCATTCGCCAGATGCTGAGACGATCTTTATCAAGCGAAAGAAGGTCAACTGAAGTTCCAAAAGGGCATGTTGCCGTCTATGTTGGGGAGGATGAAAAGAAGCGTTTTGTGATTCCAGTATCATACTTGAACCACCCCTCGTGTCAAGAATTACTGTTTCATGCAGAGGAAGAGTTTGGGTTCAATCACCCTATGGGTGGCCTCACCATCCCTTGCAGTGAGGACTTGTTTGTAGATTTCATCTCTTGCTTCAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788541.1
MAIRQMLRRSLSSERRSTEVPKGHVAVYVGEDEKKRFVIPVSYLNHPSCQELLFHAEEEFGFNHPMGGLTIPCSEDLFVDFISCFNTR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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