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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005236`

染色体: Chr01 坐标: 69931647-69932257 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005236`
名称	SmilChr01G005236
描述	auxin-responsive protein SAUR20-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69931647 - 69932257 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005563`
GeneID	`131005563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005563`
原始查询	`SmilChr01G005236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	auxin-responsive protein SAUR20-like
产物	auxin-responsive protein SAUR20-like
Arabidopsis	`AT2G21210` (AT2G21210) SAUR-like auxin-responsive protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816658] identity=58.3; qcov=1.08; evalue=3.37e-32; confidence=medium
Rice	`Os08g0118500` (OsSAUR31) - identity=60.6; qcov=0.742; evalue=6.68e-21; confidence=medium
GO	GO:0009733 (response to auxin)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02519 (Auxin_inducible)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788556.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788556.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057788556.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788556.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69931865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8
`Chr1:69931873`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,C23,C3,D8
`Chr1:69931892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B131,B140
`Chr1:69931895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C12,C85
`Chr1:69931930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C85
`Chr1:69931982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:69931991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr1:69932017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A16,B105,B123,B139,B21,B45,B86,C63,C65,C67,C70,C86
`Chr1:69932019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B36,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788556.1

89 aa

Auxin_inducible

PF02519 Auxin_inducible 9-83 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788556.1`	Pfam	`PF02519`	Auxin_inducible	Domain	9	83	7.6e-23	81.3	Auxin responsive protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932573.1
TCCAAATCTCATAGCTACCACACATCCATTTCAACTAGCAACTCTGAATTCCAAAGAGATAAGTACACATTTCTTTTCCACCTATATATATAGACAACACATTTCTCATCTTCAACCATCAACAAGCCTTCTTTAGCTTTCTTCTTGATTTTGATTTCTTTCACACCTACTAGCTAGATAAAAAGAAGATAATAAATCTCTCATTTCACTTACTTGATTTGTTACACAATGGCCATCCGCCAGATGTTGAGACGGTCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005563
ATGGCCATCCGCCAGATGTTGAGACGGTCTTTATCCAGCGAGAGAAGGTCATCTGAAGTAATTCCCAAGGGACATCTTGCTGTTTATGTTGGTGATAATGAAAAGAAGCGGTTTGTGATTCCAGTGGCGTACTTGAACCACCCCTCGTTTCAAGAGCTGTTGTTCCAAGCTGAGGAAGAATTCGGGTTCAACCACCCGATGGGCGGCCTCACCATCCCTTGCAGTCAAGAATCATTTGTAGATTTCATCTCTGGCTTCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788556.1
MAIRQMLRRSLSSERRSSEVIPKGHLAVYVGDNEKKRFVIPVAYLNHPSFQELLFQAEEEFGFNHPMGGLTIPCSQESFVDFISGFSTR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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