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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005245`

染色体: Chr01 坐标: 69967136-69969848 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005245`
名称	SmilChr01G005245
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 14b
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	69967136 - 69969848 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005578`
GeneID	`131005578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005578`
原始查询	`SmilChr01G005245`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription initiation factor TFIID subunit 14b
产物	transcription initiation factor TFIID subunit 14b
Arabidopsis	`AT5G45600` (GAS41) YEATS family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834599] identity=72.1; qcov=0.878; evalue=4.8e-111; confidence=high
Rice	`Os06g0137300` - identity=71.8; qcov=0.852; evalue=2e-104; confidence=high
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03366 (YEATS); PF20305 (pYEATS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788570.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057788570.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788571.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057788571.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:69968434`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:69968461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B22
`Chr1:69968641`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:69968687`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B139,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788570.1

271 aa

136

271

YEATS

pYEATS

PF03366 YEATS 66-145 aa PF20305 pYEATS 69-130 aa

XP_057788571.1

237 aa

118

237

YEATS

pYEATS

PF03366 YEATS 32-111 aa PF20305 pYEATS 35-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788570.1`	Pfam	`PF03366`	YEATS	Domain	66	145	1.2e-29	102.8	YEATS family
`XP_057788570.1`	Pfam	`PF20305`	pYEATS	Family	69	130	2.2e-11	44.1	prokaryotic YEATS domain
`XP_057788571.1`	Pfam	`PF03366`	YEATS	Domain	32	111	9.5e-30	103.1	YEATS family
`XP_057788571.1`	Pfam	`PF20305`	pYEATS	Family	35	96	1.8e-11	44.4	prokaryotic YEATS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932587.1
AAAATCTATCAATCATTTTATTAGATCTAGTGCTGAGCCAAAATAACATATTTCTAGCGCAGGAAGTATTAAATTTATCAAACCAAGTATTAATTAAATCTGCAAATCCATAAATTTAGCTAAAGGTGGAGCTCTCCGTAGCAGATACTTAGCTCCGGTTTACTCTCTCAGTCCACTACCGTACATTCGTACACAGGATCTAATTGCAATTTGAAAACCCTAATTTCAGCTCGATCAAATTTGGGGTTTTTTTCCTAGCT...

XM_057932588.1
ATCAATCATTTTATTAGATCTAGTGCTGAGCCAAAATAACATATTTCTAGCGCAGGAAGTATTAAATTTATCAAACCAAGTATTAATTAAATCTGCAAATCCATAAATTTAGCTAAAGGTGGAGCTCTCCGTAGCAGATACTTAGCTCCGGTTTACTCTCTCAGTCCACTACCGTACATTCGTACACAGGATCTAATTGCAATTTGAAAACCCTAATTTCAGCTCGATCAAATTTGGGGTTTTTTTCCTAGCTCAATTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005578
ATGCCTCAGAAGAATGGAGCTGACCAGTCGGATGCCAGCGGCTCGATGCCAAAATCGCAGCGCACAAAAATTGTTAAATCTTCGGATGACAGTGAAAAAAAGAATCTGGCTAAAAAGATTAAAGATACAGAAATTTGTGTACCCATTGTGTATGGTAACATTGCATTTTGGCTTGGTAAGAAGGCGAGCGAGTACCAGTCACATAAATGGACAGTTTATGTTCGTGGATCGACCAATGAGGACCTCGGAGTGGTGGTTAA...

LOC131005578
ATGGAGCTGACCAGTCGGATGCCAGCGGCTCGATGCCAAAATCGCAGCGCACAAAAATTGTTAAATCTTCGGATGACAGTGAAAAAAAGGTACCAGTCACATAAATGGACAGTTTATGTTCGTGGATCGACCAATGAGGACCTCGGAGTGGTGGTTAAGCGTGCTGTTTTTCAGTTGCATTCTAGTTTTAATAATCCCACAAGGATTATTGATAGCCCACCTTTTGAGTTATCAGAATCAGGATGGGGTGAATTTGAAAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788570.1
MPQKNGADQSDASGSMPKSQRTKIVKSSDDSEKKNLAKKIKDTEICVPIVYGNIAFWLGKKASEYQSHKWTVYVRGSTNEDLGVVVKRAVFQLHSSFNNPTRIIDSPPFELSESGWGEFEIAITLHFHSDVSDKPLHLYHHLKLYPEDESGPLSTKKPVVVESYDEVVISEPSEAFFARVQHHPAVIVPRLSAGFTLPPVPMEDLVNRNRGDTKDHHPLNQWFSKFSEADELLRLAAAREQVQGHIARLRRQLSLIDGQQ...

XP_057788571.1
MELTSRMPAARCQNRSAQKLLNLRMTVKKRYQSHKWTVYVRGSTNEDLGVVVKRAVFQLHSSFNNPTRIIDSPPFELSESGWGEFEIAITLHFHSDVSDKPLHLYHHLKLYPEDESGPLSTKKPVVVESYDEVVISEPSEAFFARVQHHPAVIVPRLSAGFTLPPVPMEDLVNRNRGDTKDHHPLNQWFSKFSEADELLRLAAAREQVQGHIARLRRQLSLIDGQQQQQQLKTASDM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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