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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005250`

染色体: Chr01 坐标: 70026460-70028817 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005250`
名称	SmilChr01G005250
描述	probable ribosome-binding factor A, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70026460 - 70028817 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005586`
GeneID	`131005586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005586`
原始查询	`SmilChr01G005250`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ribosome-binding factor A, chloroplastic
产物	probable ribosome-binding factor A%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G34730` (AT4G34730) ribosome-binding factor A family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829625] identity=66.3; qcov=0.921; evalue=2.92e-85; confidence=high
Rice	`Os06g0137600` (P0548D03.37-1) - identity=61.2; qcov=0.856; evalue=8.38e-75; confidence=high
GO	GO:0006364 (rRNA processing); GO:0042254 (ribosome biogenesis); GO:0043024 (ribosomal small subunit binding)
KEGG	-
Pfam	PF02033 (RBFA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057788576.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057788576.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788576.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788576.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788576.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70026577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70026581`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70026664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:70026733`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B59
`Chr1:70026733`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B59
`Chr1:70026784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70027925`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B72,C72
`Chr1:70028371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,C39,C8,C82
`Chr1:70028421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C8,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788576.1

229 aa

114

229

RBFA

PF02033 RBFA 66-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788576.1`	Pfam	`PF02033`	RBFA	Family	66	182	1e-26	94.0	Ribosome-binding factor A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095293.1
ATTTTGTATTCCCCAAAATACCCTCAACGGCGAAACAGATTTTTCTGAGAATTTCTGGTTTTCTTCCCTCTCAATTCTCTCTCAATCGACAAATCGACTATACTCTCAAATGCCGCACCTTCTAGCTCACCCTTCAGCAATCTCTCTACCAAATCCAGCATCACATTCGACGCCGTCGTTTTGCCCAGTCGCGTACGTCGGCCTCCGCCGTCCGCCGCCGCACCGGATGGTTTCCACCACCAGCTGCGGCGGCGGCGGAG...

XM_057932593.1
ATTTTGTATTCCCCAAAATACCCTCAACGGCGAAACAGATTTTTCTGAGAATTTCTGGTTTTCTTCCCTCTCAATTCTCTCTCAATCGACAAATCGACTATACTCTCAAATGCCGCACCTTCTAGCTCACCCTTCAGCAATCTCTCTACCAAATCCAGCATCACATTCGACGCCGTCGTTTTGCCCAGTCGCGTACGTCGGCCTCCGCCGTCCGCCGCCGCACCGGATGGTTTCCACCACCAGCTGCGGCGGCGGCGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005586
ATGCCGCACCTTCTAGCTCACCCTTCAGCAATCTCTCTACCAAATCCAGCATCACATTCGACGCCGTCGTTTTGCCCAGTCGCGTACGTCGGCCTCCGCCGTCCGCCGCCGCACCGGATGGTTTCCACCACCAGCTGCGGCGGCGGCGGAGGTAGCGGCGGAAAGAGCACAATTGTATGCATGGCGAACCCTAGGAGGGTGAAAATGGTGGCGAAGCAGATTAGGAGAGAGATTTCCGACATGTTGCTTACCGATAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788576.1
MPHLLAHPSAISLPNPASHSTPSFCPVAYVGLRRPPPHRMVSTTSCGGGGGSGGKSTIVCMANPRRVKMVAKQIRREISDMLLTDKVLQYAVLPEAALGADRYLSSLTTISDVEVSADLQVVKVYVSVFGDERGKEVALAGLKAKAKYVRSELGKRMKLRLTPEVRFLEDESLERGSRVIAILDKLKDENAKKGNSDEDGDHGEFSDRRDDDVEWEGDEIDDEGIIYVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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