当前解析结果
SmilChr01G005251| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005251 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005251 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G005251 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 70029323 - 70031349 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005587 |
|---|---|
| GeneID | 131005587 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005587 |
| 原始查询 | SmilChr01G005251 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ATP synthase E chain [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831384]; symbol=AT5G15320; hit=AT5G15320; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | ATP synthase E chain [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831384]; symbol=AT5G15320; hit=AT5G15320; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G15320 (AT5G15320)ATP synthase E chain [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831384] identity=69.4; qcov=0.925; evalue=2.72e-18; confidence=low |
| Rice | Os04g0117100 (OsmtATPS1)- identity=57.1; qcov=0.925; evalue=1.83e-11; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005587 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057788577.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057788577.1 |
| 3 | Mitochondrion inner membrane | 线粒体内膜 | 1.00000 | XP_057788579.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057788577.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788577.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:70029546 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr1:70031175 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C26 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。