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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005252`

染色体: Chr01 坐标: 70034136-70036176 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005252`
名称	SmilChr01G005252
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Pin1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70034136 - 70036176 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005588`
GeneID	`131005588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005588`
原始查询	`SmilChr01G005252`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Pin1-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase Pin1-like
Arabidopsis	`AT2G18040` (PIN1AT) peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816316] identity=72.3; qcov=1; evalue=1.48e-62; confidence=high
Rice	`Os04g0118500` - identity=66.1; qcov=0.992; evalue=1.03e-47; confidence=medium
GO	GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00639 (Rotamase); PF13616 (Rotamase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788580.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057788580.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788580.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788580.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788580.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70034364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70034388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70034415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:70034527`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788580.1

119 aa

119

Rotamase_3

Rotamase

PF13616 Rotamase_3 3-115 aa PF00639 Rotamase 11-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788580.1`	Pfam	`PF13616`	Rotamase_3	Domain	3	115	5e-19	69.6	PPIC-type PPIASE domain
`XP_057788580.1`	Pfam	`PF00639`	Rotamase	Domain	11	117	2e-22	80.7	PPIC-type PPIASE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932597.1
TTTCCAAATTTGTAGAGATGAATTGCACTTGTTTTATAGTCAAAGAGACGACACCGCTTCAATCGCACGCGAAACTCTTTAAATAATCACACAAACCACTAAGCTAAACTTTCCACTCCACTTCCACTTCCACTTCCACTTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAACTGTCTCTCTCTCACATAGATCGGGCGGAAATGTCGTCGAGCGAGCAGGTTCGCGCGTCGCACATACTGATAAAGCACGAAGGATCGCGGCGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005588
ATGTCGTCGAGCGAGCAGGTTCGCGCGTCGCACATACTGATAAAGCACGAAGGATCGCGGCGGAAGTCCTCGTGGAGGGACCCCGAGGGCCGCCGCATCTCCGCCACCAAAAGGGACAGCGCCGTCGACCAGCTCAAGGTCATTCGAGACGATATCGTCACCGGAAAAACGAGGTTCGACGAAGTTGCGTCTCGCCTCTCTGACTGCAGCTCCGCCAAGCGCGGCGGCGATCTCGGTCCCTTTGGCCGAGGTCAGATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788580.1
MSSSEQVRASHILIKHEGSRRKSSWRDPEGRRISATKRDSAVDQLKVIRDDIVTGKTRFDEVASRLSDCSSAKRGGDLGPFGRGQMQKPFEDVTFSLKVGEISDIVDTDSGTHLIMRTG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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