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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005261`

染色体: Chr01 坐标: 70089553-70092093 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005261`
名称	SmilChr01G005261
描述	eukaryotic translation initiation factor 4B3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70089553 - 70092093 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005597`
GeneID	`131005597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005597`
原始查询	`SmilChr01G005261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 4B3
产物	eukaryotic translation initiation factor 4B3
Arabidopsis	`AT4G38710` (AT4G38710) glycine-rich protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830027] identity=46.5; qcov=1.07; evalue=6.26e-78; confidence=high
Rice	`Os02g0439700` - identity=36.7; qcov=1.09; evalue=8.02e-48; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF06273 (eIF-4B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788591.1`
2	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.80000	`XP_057788591.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788591.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.60000	`XP_057788591.1`
5	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057788591.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70089811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:70090054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B46
`Chr1:70090124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70090201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70090512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr1:70090549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C31
`Chr1:70090557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C31
`Chr1:70090735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B100,B104,D11
`Chr1:70090747`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B100,B104,D11
`Chr1:70090803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:70091798`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788591.1

409 aa

204

409

eIF-4B

PF06273 eIF-4B 8-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788591.1`	Pfam	`PF06273`	eIF-4B	Family	8	341	3.1e-43	149.3	Plant specific eukaryotic initiation factor 4B

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932608.1
CAAGGGACGCAAAATCTTCACAAAACCTATCGCCACACACACTAACGCACCATCAAAACACACACAGAATAAATCGGATACACCACACGACAGAGAAATCGTGAAGCAGGGAATCATGGCGGCTACGGTGAAGACGGCGTGGGCGAAGCCAGGCGCGTGGGCTCTGGACGCGGAGGAGAACGAGACGGAGCTCCTCCAGCAACAGAAGGAGGATTCGGCGGCCGCCGCGGCCGCGACCAACGGCCACTCTGAGACGGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005597
ATGGCGGCTACGGTGAAGACGGCGTGGGCGAAGCCAGGCGCGTGGGCTCTGGACGCGGAGGAGAACGAGACGGAGCTCCTCCAGCAACAGAAGGAGGATTCGGCGGCCGCCGCGGCCGCGACCAACGGCCACTCTGAGACGGCGGATTTCCCGTCGCTGGCGGCGGCGAAGACTAAGAAGAAGAAGAAGCAGGTCCTGTCGCTCCAGGAATTCACGACCTACAGCGCGGCGAAGCCGGCGGCGTTCCAGGCGTCGAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788591.1
MAATVKTAWAKPGAWALDAEENETELLQQQKEDSAAAAAATNGHSETADFPSLAAAKTKKKKKQVLSLQEFTTYSAAKPAAFQASKGLTTDELMALPTGPRERSAEELDRSKGFRSYGSGMRDEQPRRQGSFNRESNREIAPSRADETDNWAAGKRSPASSGFERRERGERGGFFTDSQSRADEVDNWASNKSFAPSSEPRRYERRGSFGLESSNGGADSGSWVKRREEEGPRMGGAFDSLRERRGGSDLNGADSESWGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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