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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005262`

染色体: Chr01 坐标: 70093381-70095030 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005262`
名称	SmilChr01G005262
描述	uncharacterized SmilChr01G005262
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70093381 - 70095030 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005598`
GeneID	`131005598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005598`
原始查询	`SmilChr01G005262`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816164]; symbol=AT2G16630; hit=AT2G16630; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816164]; symbol=AT2G16630; hit=AT2G16630; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G16630` (AT2G16630) Pollen Ole e 1 allergen and extensin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816164] identity=47.5; qcov=1.19; evalue=5e-103; confidence=high
Rice	`Os01g0726700` - identity=33.3; qcov=0.49; evalue=5.63e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27764 (PDF1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057788592.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057788592.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788592.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788592.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70093831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr1:70093951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B129,B140,B36,D11
`Chr1:70093959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B8,C64
`Chr1:70094074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B36,C33
`Chr1:70094096`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:70094147`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:70094170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B88
`Chr1:70094452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:70094468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B88
`Chr1:70094482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr1:70094668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr1:70094706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788592.1

300 aa

150

300

PDF1_C

PF27764 PDF1_C 189-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788592.1`	Pfam	`PF27764`	PDF1_C	Domain	189	288	7.8e-12	46.4	Protodermal factor 1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932609.1
TATTACTACAAAAACACCGGCTCCTCTTTTTTCTATGTTTTTATTGTAAAAGTGCTCTCATTCACATTAATTCACATCTAGAAAGCCTCTTTACAGAGCTTTACTACTTATAGCCATTCATTTCTCGACAGCTCCAATCTTGTCTCAACTCATGGATTGGTTGCGCAAGTTTTTCTTCACGGCTTTCCTCGTCGCCGCCGCCGCGATCGGCGGCGCCCGCGGCGACGCCATGGTCACCGGAACCGTGTTTTGTGATCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005598
ATGGATTGGTTGCGCAAGTTTTTCTTCACGGCTTTCCTCGTCGCCGCCGCCGCGATCGGCGGCGCCCGCGGCGACGCCATGGTCACCGGAACCGTGTTTTGTGATCAATGCAAAGATGGCCAGATTTCCCTCTTTGATTATCCCTTAAATGGGATTAAGGTGACGATGGCCTGCCCGGGCAGCGACGGGCAGTACACGACGTGGGGGGAGCAGACCACCAACTGGCTAGGCAACTATGCTATGAGGGTTGGTGGTGCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788592.1
MDWLRKFFFTAFLVAAAAIGGARGDAMVTGTVFCDQCKDGQISLFDYPLNGIKVTMACPGSDGQYTTWGEQTTNWLGNYAMRVGGAPNLSGCYTQVSGSGQGSNACGAAAGPAKRLRLMFNMFDTEMYTVEPLLAQPAQPMSFCPSSTPAPVVPVNPPPAPLLPPVPRFPPTPFLEASACPHQMWLMPEYQCYWKVVSPDTKVAVAFGLIAGRRFGTDMTLRQGMLGRGDPYRTLLREGTTALLNSYNSIQFPYHPLGVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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