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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005276`

染色体: Chr01 坐标: 70180278-70183704 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005276`
名称	SmilChr01G005276
描述	probable magnesium transporter NIPA6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70180278 - 70183704 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005611`
GeneID	`131005611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005611`
原始查询	`SmilChr01G005276`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable magnesium transporter NIPA6
产物	probable magnesium transporter NIPA6
Arabidopsis	`AT2G21120` (AT2G21120) magnesium transporter, putative (DUF803) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816647] identity=71.5; qcov=0.972; evalue=1.87e-144; confidence=high
Rice	`Os05g0430700` - identity=63.1; qcov=1.02; evalue=1.38e-124; confidence=high
GO	GO:0015095 (magnesium ion transmembrane transporter activity); GO:0015693 (magnesium ion transport); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF05653 (Mg_trans_NIPA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057788603.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057788604.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057788603.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788603.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788603.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70180768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C26
`Chr1:70181615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,C86
`Chr1:70181916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70182851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B78,C71,C82
`Chr1:70182869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:70183017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:70183109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788603.1

339 aa

170

339

Mg_trans_NIPA

PF05653 Mg_trans_NIPA 5-296 aa

XP_057788604.1

282 aa

141

282

Mg_trans_NIPA

PF05653 Mg_trans_NIPA 1-239 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788603.1`	Pfam	`PF05653`	Mg_trans_NIPA	Family	5	296	6.9e-133	443.0	Magnesium transporter NIPA
`XP_057788604.1`	Pfam	`PF05653`	Mg_trans_NIPA	Family	1	239	3.5e-106	355.4	Magnesium transporter NIPA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932620.1
AGAGCCGTTGACCGCTCGCTTTATTTCTATTTCTAATTTTTTATGTTATTTTTTTCTTCGTAATATTTTCGTCAAATTTTGCGGATTCAATCATCAATATTCAATACCACCCGCAGACACCAAATCGTTGATTCATAGCAGTTTATGAATACCTTTTTCTCGGGCAGAGAAACAAACAGTTAATCGCCGGCGGCTGGCTGTTTATCAATATCTCTTTTATTTGTTTTTTTCAACGATCGTTTGTGGTTGGAAATTGGATT...

XM_057932621.1
ATTTTCGTCAAATTTTGCGGATTCAATCATCAATATTCAATACCACCCGCAGACACCAAATCGTTGATTCATAGCAGTTTATGAATACCTTTTTCTCGGGCAGAGAAACAAACAGTTAATCGCCGGCGGCTGGCTGTTTATCAATATCTCTTTTATTTGTTTTTTTCAACGATCGTTTGTGGTTGGAAATTGGATTTTTCTCGGGCCCTTTCTGATTGGCGGGAGTTCGAATTTTGGTAAAAGTTTCGGTTTTTGGCTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005611
ATGGGGGTTTCGGATAATACGAGGGGATTGTTATTGGCAATGGTGTCGAGTTTGTTTATCGGAACGAGCTTTATTTTTAAGAAGAAAGGTCTTCTGCGAGCTGCTGCTGCTGGTACACGCGCAGGTGTTGGAGGCTACACTTACTTGTTAGAACCTCTTTGGTGGGCCGGCATGATTTCTATGATTGTTGGGGAGATTGCGAATTTTGTTGCTTATATCTATGCCCCTGCTGTTCTTGTTACCCCTCTTGGTGCATTGAG...

LOC131005611
ATGATTTCTATGATTGTTGGGGAGATTGCGAATTTTGTTGCTTATATCTATGCCCCTGCTGTTCTTGTTACCCCTCTTGGTGCATTGAGCATAATCGTTAGTGCTGTTTTAGCACACTTTCTGTTGAAGGAACCACTGCGACAGATGGGAATTTTGGGGATTGTGTCTTGCATAGTTGGATCGGTTGTAATTGTCGTTCATGCCCCTCAAGAACACACTCCATCTTCTGTTCAAGAAGTCTGGGATTTGGCATCTCAGCC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788603.1
MGVSDNTRGLLLAMVSSLFIGTSFIFKKKGLLRAAAAGTRAGVGGYTYLLEPLWWAGMISMIVGEIANFVAYIYAPAVLVTPLGALSIIVSAVLAHFLLKEPLRQMGILGIVSCIVGSVVIVVHAPQEHTPSSVQEVWDLASQPAFLIYVAASVSLVLLLILYLEPLYGQTNILVYLGICSLLGAITVMSVKAVGIAIKLTLEGINQFGSTQTWFFLSVAVFCLITQLNYLNKALDTFNAAIVSPIHYVMFTTLTIIASS...

XP_057788604.1
MISMIVGEIANFVAYIYAPAVLVTPLGALSIIVSAVLAHFLLKEPLRQMGILGIVSCIVGSVVIVVHAPQEHTPSSVQEVWDLASQPAFLIYVAASVSLVLLLILYLEPLYGQTNILVYLGICSLLGAITVMSVKAVGIAIKLTLEGINQFGSTQTWFFLSVAVFCLITQLNYLNKALDTFNAAIVSPIHYVMFTTLTIIASSIMFKDWSGQNASSITSEVCGFITVLSGTLILHMTREEEASPPPTGTIIWYDGDSSKA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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