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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005285`

染色体: Chr01 坐标: 70215899-70216693 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005285`
名称	SmilChr01G005285
描述	dirigent protein 23-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70215899 - 70216693 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005620`
GeneID	`131005620`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005620`
原始查询	`SmilChr01G005285`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 23-like
产物	dirigent protein 23-like
Arabidopsis	`AT2G21100` (AT2G21100) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816645] identity=45.6; qcov=0.892; evalue=5.08e-50; confidence=medium
Rice	`Os12g0174700` - identity=51.7; qcov=0.711; evalue=2.35e-45; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005620

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057788613.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788613.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788613.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788613.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70216029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C14,C81
`Chr1:70216050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:70216051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:70216085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	73	A11,A13,A14,A15,A16,A2,A23,A24,A3,A4,A5,A9,B105,B11,B112,B114,B12,B121,B128,B132,B135,B22,B3,B4,B44,B45,B47,B49,B56,B58,B59,B60,B61,B69,B70,B75,B77,B78,B84,B87,B89,B9,B94,B96,C11,C13,C16,C19,C20,C33,C34,C4,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C57,C6,C61,C62,C67,C69,C7,C71,C78,C83,C9,D1,D3,D7,D8
`Chr1:70216088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:70216117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:70216210`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C48
`Chr1:70216252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A18,B52,C48
`Chr1:70216260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:70216290`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	21	A3,A7,B107,B125,B128,B19,B20,B21,B30,B40,B55,B63,B77,B88,B90,B94,C16,C60,C70,C80,D9
`Chr1:70216294`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B6,C39
`Chr1:70216303`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788613.1

204 aa

102

204

Dirigent

PF03018 Dirigent 52-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788613.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	52	193	2.5e-47	161.0	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932630.1
ATTTCAACTAATTAACATATCTCGTCTCCATATTATAGATTCCATATCATTTTGCTATATACATTTGATGGAGAAAAACAAAGAGCTAACAATGCCAACTCTAAATCTCCTTTCAATTTTAATCTTTATTGTTTCATCCATTAATGCAGGAGCGGATCATGCCCAACTCAATCATCAAAATTCATGGGCGAAGAGAGTGGAGAGAGGAAATGAGGTAACAACCACTCTCCAATTCTACTTCCACAACATACCTAACGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005620
ATGGAGAAAAACAAAGAGCTAACAATGCCAACTCTAAATCTCCTTTCAATTTTAATCTTTATTGTTTCATCCATTAATGCAGGAGCGGATCATGCCCAACTCAATCATCAAAATTCATGGGCGAAGAGAGTGGAGAGAGGAAATGAGGTAACAACCACTCTCCAATTCTACTTCCACAACATACCTAACGGGCCGGGCCCAACATCGGTGAGGATAGCCGAAGCAGCCCAAACCAACAGCTCGCGCACTTTTTTCGGAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788613.1
MEKNKELTMPTLNLLSILIFIVSSINAGADHAQLNHQNSWAKRVERGNEVTTTLQFYFHNIPNGPGPTSVRIAEAAQTNSSRTFFGALMMIDDPLTVGPDPSSRIVGRARGLMGSAGLNKFTLIMAVSYVFTDGIYNGSSFSLLSINEVLRPAQEMAVVGGTGLFRLARGHVVARTHSIDAMSVAIVEYNVTIATYDYSKHPHE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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