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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005292`

染色体: Chr01 坐标: 70251850-70252761 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005292`
名称	SmilChr01G005292
描述	dirigent protein 22-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70251850 - 70252761 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005625`
GeneID	`131005625`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005625`
原始查询	`SmilChr01G005292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 22-like
产物	dirigent protein 22-like
Arabidopsis	`AT1G22900` (AT1G22900) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838897] identity=39.6; qcov=0.934; evalue=1.38e-37; confidence=medium
Rice	`Os12g0174700` - identity=46.9; qcov=0.678; evalue=3.15e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005625

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057788618.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788618.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788618.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788618.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788618.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70251977`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B112,B22,B72,B8,B81,C82
`Chr1:70251981`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B13,C14,C38,C52,C8,D10
`Chr1:70251984`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B13,C14,C38,C52,C8,D10
`Chr1:70252069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70252073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C77,D1
`Chr1:70252082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:70252099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70252277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:70252329`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B109,B83,C22,C39
`Chr1:70252329`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B109,B83,C22,C39
`Chr1:70252470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788618.1

211 aa

106

211

Dirigent

PF03018 Dirigent 52-195 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788618.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	52	195	5e-44	150.3	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932635.1
ATCCCACTTGTTCCATAACTATTTAATTGTTATTAATATTTGATAGATATAAATCTCTATATAAACCCATCTCTAGATTCAAAACCAATCACACCTTCTCTAGCTAAAATCAAATTACAAACAATGGCAACACCAATCTCTATTGTGCTAATTCTAACAATCTCATGCTTGCTCGTGTCCACTTTAGACGTGTATGCTAGAAAGCAAGCTTCCTCTGACGTTGCAGAGGAAGCAACATCCTTCCTCCACGACATATGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005625
ATGGCAACACCAATCTCTATTGTGCTAATTCTAACAATCTCATGCTTGCTCGTGTCCACTTTAGACGTGTATGCTAGAAAGCAAGCTTCCTCTGACGTTGCAGAGGAAGCAACATCCTTCCTCCACGACATATGTGGAGGAAGAGAAAAGGTTATGAAACTCCAATTATACGTCCAAGACCTCCGGATCGGTCACCCGAACGCCACCGTGGTGGAGGTGGCAAAAGCCGCCGGTGTCACCGACAATTCCCCGTACCAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788618.1
MATPISIVLILTISCLLVSTLDVYARKQASSDVAEEATSFLHDICGGREKVMKLQLYVQDLRIGHPNATVVEVAKAAGVTDNSPYQFGSVHVLDDLVTEGPSINSRKLGRIQGLTTNADLSTFGIAMNLNFFFTEGWYAGSTLSILGRNQVMDSQRELPVVGGTGVFRYARGYAIQTSYSFDPATNYAVLEYNIYTTYNARFNEDVEIARM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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