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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005299`

染色体: Chr01 坐标: 70289908-70290940 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005299`
名称	SmilChr01G005299
描述	dirigent protein 21-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70289908 - 70290940 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005632`
GeneID	`131005632`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005632`
原始查询	`SmilChr01G005299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dirigent protein 21-like
产物	dirigent protein 21-like
Arabidopsis	`AT1G65870` (AT1G65870) Disease resistance-responsive (dirigent-like protein) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842898] identity=45.2; qcov=0.613; evalue=1.1e-38; confidence=medium
Rice	`Os12g0174700` - identity=45.9; qcov=0.613; evalue=1.26e-34; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03018 (Dirigent)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005632

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057788622.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788622.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788622.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788622.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788622.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70290043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:70290128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,B82,C51,D4
`Chr1:70290183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:70290245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B108,C2
`Chr1:70290254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:70290311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:70290403`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B91
`Chr1:70290403`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B91
`Chr1:70290428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B108,C23
`Chr1:70290473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,B2
`Chr1:70290672`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C68
`Chr1:70290672`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788622.1

238 aa

119

238

Dirigent

PF03018 Dirigent 85-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788622.1`	Pfam	`PF03018`	Dirigent	Family	85	227	2.2e-44	151.5	Dirigent-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932639.1
ATCTAGTTACAAAAATTTCGTACTAGTTAATGATGTTGAATGTTATCTAATCCAACCTGTCAAAAGCCAAAGCGTACAAAAATGAAACTACCAACTACTTCTAAATTTCCTCTTTGAAGTTTGACCTAGTACTTTATGATATATATATACAAAAGATACGTGACATAGTAAAACAAAAGATATATATACATGCATACAATCATCCTTCTTCAACACCTCCAAATTAACTCTCACTCCAATCTTCAAGAGAAAACCTTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005632
ATGCATACAATCATCCTTCTTCAACACCTCCAAATTAACTCTCACTCCAATCTTCAAGAGAAAACCTTCCCAAAAAAGGAAACTTATAAGATGAAGAATCAAACCATAGGTAGTCTTCTCTTGATACTCTCCTGCCTCCTCATCGCCACCCCTTCTCCCACACACGCAAGAAAATTCCCCGACGCCACCGCCACCGCCGCCTCCGCCGGTAAAGCATGGGTCCGTACCATCGTGAGAGGAAGCGAGAACATAACACAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788622.1
MHTIILLQHLQINSHSNLQEKTFPKKETYKMKNQTIGSLLLILSCLLIATPSPTHARKFPDATATAASAGKAWVRTIVRGSENITQLHFYVHDVRAGANATLYGVANASITATSPTSFGQVNVFDDLVTAEPDIAGAEVARAQGTTASAGLEDRAVAISMNFYITSGEFAGSTVSIAGRNPVTEASRELPVIGGTGAFRYARGYAVTTTYLNDAETNYSVLEYTVYVSYSNVALWMDM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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