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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005328`

染色体: Chr01 坐标: 70487781-70489021 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005328`
名称	SmilChr01G005328
描述	uncharacterized SmilChr01G005328
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70487781 - 70489021 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012497`
GeneID	`131012497`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012497`
原始查询	`SmilChr01G005328`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LACS8; symbol=LACS8; hit=Os05g0317200; species=rice; confidence=low
产物	LACS8; symbol=LACS8; hit=Os05g0317200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G04350` (LACS8) AMP-dependent synthetase and ligase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814974] identity=55.1; qcov=0.578; evalue=2.66e-24; confidence=medium
Rice	`Os05g0317200` (LACS8) - identity=68.8; qcov=0.416; evalue=1.91e-24; confidence=low
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	-
Pfam	PF00444 (Ribosomal_L36)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012497

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796473.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057796473.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796473.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796473.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70487961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr1:70487981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B82,B93
`Chr1:70488649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:70488720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A11,A13,A18,A25,B134,B62,B63,C30,C36,C71,C87
`Chr1:70488912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C38,C52
`Chr1:70488915`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	4	B140,B65,B92,C13
`Chr1:70488915`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B140,B65,B92,C13
`Chr1:70488920`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B140,B65,B92,C13
`Chr1:70488920`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B140,B65,B92,C13
`Chr1:70488942`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B51,B95,C56
`Chr1:70488942`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B51,B95,C56
`Chr1:70488945`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	10	B111,B18,B2,B30,C2,C31,C41,C73,C77,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796473.1

185 aa

185

Ribosomal_L36

PF00444 Ribosomal_L36 10-47 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796473.1`	Pfam	`PF00444`	Ribosomal_L36	Domain	10	47	5.9e-21	75.0	Ribosomal protein L36

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940490.1
ATGGCATCATTGCTGGCCCATCCCAGGATGAAGGTCCGTTCGTCAGTCAAGAAGTTGTGTGAGTTTTGTCGGACTGTGAAGCGACGTGGGCGTGTGTATGTCCTGTGCACAGCTAATCCGAAGCACAAGCAGCGACAAGGCGTATCAACACTTGCTTATGAAGGTCCACTTGTTCCAGCGTATGACAAGTTTGAAAGAGACGACGTCAGCCCAGAATGGTCTCCCTGCCCTTATATCCAACAAGAACGAGTCGTTGACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012497
ATGGCATCATTGCTGGCCCATCCCAGGATGAAGGTCCGTTCGTCAGTCAAGAAGTTGTGTGAGTTTTGTCGGACTGTGAAGCGACGTGGGCGTGTGTATGTCCTGTGCACAGCTAATCCGAAGCACAAGCAGCGACAAGGCGTATCAACACTTGCTTATGAAGGTCCACTTGTTCCAGCGTATGACAAGTTTGAAAGAGACGACGTCAGCCCAGAATGGTCTCCCTGCCCTTATATCCAACAAGAACGAGTCGTTGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796473.1
MASLLAHPRMKVRSSVKKLCEFCRTVKRRGRVYVLCTANPKHKQRQGVSTLAYEGPLVPAYDKFERDDVSPEWSPCPYIQQERVVDSDTVVESWSRLASVQREWQQVEYMLSSNLGDCSSWCEMPEAKKEVQQSLAKAAKAAKLDKFETPAKIKLLPEPWTPESGLVTAALKLKAKFKDDLEKLY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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