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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005331`

染色体: Chr01 坐标: 70507102-70509812 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005331`
名称	SmilChr01G005331
描述	BTB/POZ domain-containing protein SR1IP1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70507102 - 70509812 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005658`
GeneID	`131005658`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005658`
原始查询	`SmilChr01G005331`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	BTB/POZ domain-containing protein SR1IP1
产物	BTB/POZ domain-containing protein SR1IP1
Arabidopsis	`AT5G67385` (AT5G67385) Phototropic-responsive NPH3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836874] identity=66.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0206700` (OSJNBa0014O06.3) - identity=55.1; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB); PF03000 (NPH3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005658

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057788664.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057788664.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057788664.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057788664.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788664.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70508129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:70508141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr1:70508142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B80
`Chr1:70508143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B41,B65,B80,C34
`Chr1:70508200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:70508296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:70508551`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,A15,B124,B78,C58
`Chr1:70508552`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A4,B101,B108,B11,B113,B2,B24,B40,B57,B67,B77,C15,C16,C46,C51,C61,D6,D8
`Chr1:70508555`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A4,B101,B108,B11,B113,B2,B24,B40,B57,B67,B77,C15,C16,C46,C51,C61,D6,D8
`Chr1:70508600`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C50
`Chr1:70508605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,B12
`Chr1:70508607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B12,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788664.1

592 aa

296

592

BTB

NPH3

PF00651 BTB 30-120 aa PF03000 NPH3 198-444 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788664.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	30	120	7.2e-08	33.3	BTB/POZ domain
`XP_057788664.1`	Pfam	`PF03000`	NPH3	Family	198	444	9.4e-90	301.5	NPH3 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932681.1
AATGGAAGTTTGAAAAAAGATTTTGACAGTTTTTTGTGGAGGATAAGAAATTTCTTAATTTGGCGCCATCCTTTCATAAATGTGACTCCCACCACACACTCTTCACCAAAATCTCTTCCCACCCACATTCCCATTTTCTCCTAATATTATCCAACGCTTTACTCATATCTCCACTTAAATTAGAGCCCTAAAATGGGGAATTCAAATTCCTCCCCAGTGATGATAATAATTAGCATGGTCGCCAGAAATGGAGAATATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005658
ATGGATCTTCAACCAGACGCTGCAAACATGTCTACCAAGAAGAAGGACCTTCTCTCCACTGCCATGAAGAGGACTAGTGAATGGATTTTTTCACAGGAGATTCCTAGTGATGTAACTGTGAATGTTGCAGGAACTTCCTTTTCTTTACACAAGTTCCCATTGGTCTCAAAATGCGGATATCTGCGGAAGCTGGTGTCGGAGTCCTCCGACGCCGACGTCTCCGCGGTGGAGCTCCCCGACGTCCCCGGCGGGGCGGAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788664.1
MDLQPDAANMSTKKKDLLSTAMKRTSEWIFSQEIPSDVTVNVAGTSFSLHKFPLVSKCGYLRKLVSESSDADVSAVELPDVPGGAEAFELAAKFCYGINFEITTENIAMLRCVAEHLEMTEEYAVGNLVARSEAYINEVALKSLAGAVSVLHSSENLLPTAEKVKLVSRCIDATALVACRDSRFASPDPSAGAAAAADWWAEDLTVLRIDLFQRVLIAMMGRGFKQYALGPILMLYAQKSLRGLDIFGKGRKKMEARQEH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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