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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005332`

染色体: Chr01 坐标: 70513261-70514959 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005332`
名称	SmilChr01G005332
描述	uncharacterized SmilChr01G005332
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70513261 - 70514959 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005659`
GeneID	`131005659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005659`
原始查询	`SmilChr01G005332`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836875]; symbol=AT5G67390; hit=AT5G67390; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	glycosyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836875]; symbol=AT5G67390; hit=AT5G67390; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G67390` (AT5G67390) glycosyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836875] identity=47.1; qcov=0.713; evalue=2.8e-24; confidence=medium
Rice	`Os03g0762100` - identity=68.1; qcov=0.329; evalue=1.91e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27565 (ELF3_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788665.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788665.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788665.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788665.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70513408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:70513542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B4,C15,C21
`Chr1:70513652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:70513819`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788665.1

143 aa

143

ELF3_helical

PF27565 ELF3_helical 11-40 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788665.1`	Pfam	`PF27565`	ELF3_helical	Domain	11	40	2.7e-16	59.8	ELF3 helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932682.1
ATAACGAATGTGGTGAATAAAGAAATAATTGGTGTGGTGGAGATGGTCGGGGCGTCTCTCCCACAAAAGCTTGAAATACACATAGAGGGTAAGGGCAGTGGGATTTGTTTGGCATGCCCCTCATCATTCACATCAAAACCCTCATTACCCATTACCAACAAACAATTGCTTTGATTTCTGTGACTACCAATTCTTTCAAATTCTTCTGTTATCTCTGTCCAAACACTTGCTCCCTATATATATACGGCGCCACTATATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005659
ATGGAGAGGCTTCTGAATCAGTACGACAAGGAATACATGAAGATGGCCATGCTCAAGCACGAGGAAACATTTCGAGAGCAGGTTTACGAGCTCCATCGCCTGTATCGAATACAGAAAATGTTGATGAAGGACATCGCCAAAAACGCGCGAATCGATCGGGCTTACAAGGGGCCCGAATCGAGGGCGGATCGGGCCGTGGAATCGGTTGGAAAATGTGGAGATGGGGAAACGGAATGCGATGATCAGAGCGATCTGGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788665.1
MERLLNQYDKEYMKMAMLKHEETFREQVYELHRLYRIQKMLMKDIAKNARIDRAYKGPESRADRAVESVGKCGDGETECDDQSDLELTLGPRSFYEKKGEGRWDKAGPRGPPLKWGPETPVSNQDRLNSPPWLFQALSLNMTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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