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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005336`

染色体: Chr01 坐标: 70567561-70571709 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005336`
名称	SmilChr01G005336
描述	uncharacterized SmilChr01G005336
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70567561 - 70571709 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005663`
GeneID	`131005663`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005663`
原始查询	`SmilChr01G005336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OSJNBb0005G07.121-1; symbol=OSJNBb0005G07.121-1; hit=Os07g0588800; species=rice; confidence=high
产物	OSJNBb0005G07.121-1; symbol=OSJNBb0005G07.121-1; hit=Os07g0588800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os07g0588800` (OSJNBb0005G07.121-1) - identity=69; qcov=1; evalue=9.97e-168; confidence=high
GO	GO:0101030 (GO:0101030)
KEGG	-
Pfam	PF10343 (Q_salvage)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005663

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788669.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788669.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057788669.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057788669.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788669.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70570769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B66,B93,C5,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788669.1

306 aa

153

306

Q_salvage

PF10343 Q_salvage 47-306 aa

XP_057788670.1

306 aa

153

306

Q_salvage

PF10343 Q_salvage 47-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788669.1`	Pfam	`PF10343`	Q_salvage	Family	47	306	6.3e-92	308.9	Queuosine salvage protein
`XP_057788670.1`	Pfam	`PF10343`	Q_salvage	Family	47	306	6.3e-92	308.9	Queuosine salvage protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932687.1
AAAGAAAAACAAACACCCACGAAAGCGGGAACTTCGAATCCAGACACCCACGTATATATCACTACTACCCATTCCTACTCCTAGGGTTTAATTGCATCATTCCTCAATTATATACACACATTATATACACAAATTGCCCAATTCTTCAAACTTTCGCAGATGGAAGAAGTTAGGGCTACCTCTGCTTGGGTCGCCTCCCGCTCATCCCACGTCACCCTCGACACCTCAGGAATTGAAAACCTCGCCGAAAGAATCAAAGA...

XM_057932686.1
AAAGAAAAACAAACACCCACGAAAGCGGGAACTTCGAATCCAGACACCCACGTATATATCACTACTACCCATTCCTACTCCTAGGGTTTAATTGCATCATTCCTCAATTATATACACACATTATATACACAAATTGCCCAATTCTTCAAACTTTCGCAGATGGAAGAAGTTAGGGCTACCTCTGCTTGGGTCGCCTCCCGCTCATCCCACGTCACCCTCGACACCTCAGGAATTGAAAACCTCGCCGAAAGAATCAAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005663
ATGGAAGAAGTTAGGGCTACCTCTGCTTGGGTCGCCTCCCGCTCATCCCACGTCACCCTCGACACCTCAGGAATTGAAAACCTCGCCGAAAGAATCAAAGATTCGGTATCAAAGGTGGAGTGGGATTTCGAAGGAATCCATTTTTTCGACAATGGACCTCTTACTGTGCAGTATCTGTTTGTGTTGGATGCACTCAATTTCTGCTTTTGGCCCGATAATGAATTGAATTATGATCATTTGGCTGCGGGATTGAAGGGAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788669.1
MEEVRATSAWVASRSSHVTLDTSGIENLAERIKDSVSKVEWDFEGIHFFDNGPLTVQYLFVLDALNFCFWPDNELNYDHLAAGLKGALQNDRSAFDADRLQKYTGPELRKMLNWPRPLPLEDERVRLLHEVGFELEKSFDGKAANLVKSCEKSAGKLVALITSHFPGFRDHSVYKGHQIFLYKRAQIFAADLWGAFKGQGYGELKDIESVTMFADYIVPAVLQQLGVLRYSPSLSGIIESNREITSGTEEEVELRACTIH...

XP_057788670.1
MEEVRATSAWVASRSSHVTLDTSGIENLAERIKDSVSKVEWDFEGIHFFDNGPLTVQYLFVLDALNFCFWPDNELNYDHLAAGLKGALQNDRSAFDADRLQKYTGPELRKMLNWPRPLPLEDERVRLLHEVGFELEKSFDGKAANLVKSCEKSAGKLVALITSHFPGFRDHSVYKGHQIFLYKRAQIFAADLWGAFKGQGYGELKDIESVTMFADYIVPAVLQQLGVLRYSPSLSGIIESNREITSGTEEEVELRACTIH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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