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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005345`

染色体: Chr01 坐标: 70672390-70676967 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005345`
名称	SmilChr01G005345
描述	coronatine-insensitive protein 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70672390 - 70676967 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005674`
GeneID	`131005674`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005674`
原始查询	`SmilChr01G005345`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coronatine-insensitive protein 1
产物	coronatine-insensitive protein 1
Arabidopsis	`AT2G39940` (COI1) RNI-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818581] identity=67.6; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0449500` (OsCOI1b) - identity=57.9; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF18511 (F-box_5); PF18791 (Transp_inhibit)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005674

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057788688.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788688.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057788688.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788688.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70672831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B78,C48
`Chr1:70672840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B46
`Chr1:70673143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B3,B76,B77,C53
`Chr1:70674482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C64
`Chr1:70674534`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B49,C50
`Chr1:70674743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:70676182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C53,C61
`Chr1:70676214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B50
`Chr1:70676245`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B2,B50
`Chr1:70676245`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B2,B50
`Chr1:70676249`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B2,B50
`Chr1:70676249`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B2,B50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788688.1

598 aa

299

598

F-box_5

Transp_inhibit

PF18511 F-box_5 26-66 aa PF18791 Transp_inhibit 85-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788688.1`	Pfam	`PF18511`	F-box_5	Domain	26	66	5.4e-24	84.2	F-box
`XP_057788688.1`	Pfam	`PF18791`	Transp_inhibit	Repeat	85	131	2e-20	72.7	Transport inhibitor response 1 protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932705.1
GTCTATAATGAGATTGGGGTGAGGCTGACGTCCGCTTCCCCCAATTGGTTACCTTTCGCCTCTTTTGTCCTCTCCTCAACCCTCTCACCCATTTCTTCAGCCGCACAGAAACTCAAAGCCATCTCCCCATTGCCCTCCATCAACACCACAATCACTCCCAAAACCACCCCTACCCTACTCCTGACCCCCCCCCCCCGCCTACCCCACCCTAGGATCCAGCCTTCGTTTATCTCATTATTTTCTCTTCGATCAGTCTCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005674
ATGGATGAGAGGAAATCGAAGAGACCGAACGGTTTCAGCAGCCGGAGCTGCGGAGTCAGCAGCAGCGGAAGTAGCAGCGGCGCGTACGACACCGTATGGGAGTGCGTGATCCCGTACGTGCAGGACCCGCGCGACCGGGACGCGGTGTCGCTGGTGTGCAAGCGGTGGTACGAGATCGACGCCATCACGCGCAAGCACGTGACCATGGCGCTCTGCTACACCGCCACGCCGCAGCGGCTGTCGCGCCGGTTCCCCCATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788688.1
MDERKSKRPNGFSSRSCGVSSSGSSSGAYDTVWECVIPYVQDPRDRDAVSLVCKRWYEIDAITRKHVTMALCYTATPQRLSRRFPHLESLKLKGKPRAAMFNLIQEDWGGFVTPWVEEIIRSFGRMKVLHFRRMIVKDSDLELLATSLGKVLEVLRLDKCSGFSTDGLLRIGKFCRNLRNLLLEESSIIENDGEWLNELAMNNTVLESLNFYMTDLMKVRSRDLELIARRCPSLASMKISDCDVSDLIGFFRAAASLEEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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