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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005349`

染色体: Chr01 坐标: 70744349-70746037 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005349`
名称	SmilChr01G005349
描述	uncharacterized acetyltransferase At3g50280-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70744349 - 70746037 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005676`
GeneID	`131005676`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005676`
原始查询	`SmilChr01G005349`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818586]; symbol=AT2G39980; hit=AT2G39980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818586]; symbol=AT2G39980; hit=AT2G39980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G39980` (AT2G39980) HXXXD-type acyl-transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818586] identity=63.8; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0449200` - identity=50.9; qcov=0.996; evalue=6.39e-146; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02458 (Transferase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005676

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788691.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788691.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788691.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788691.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70744478`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,B64,C6,C72
`Chr1:70744566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B98
`Chr1:70744611`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B35,C39
`Chr1:70744611`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B35,C39
`Chr1:70744618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70744629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70744658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:70744691`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C29
`Chr1:70745067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B27,C17,D3
`Chr1:70745092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	20	A22,B135,B19,B24,B32,B41,B62,B69,B86,B96,C1,C19,C2,C22,C3,C73,C74,C79,C80,D1
`Chr1:70745125`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	64	A10,A4,A6,B1,B101,B103,B105,B107,B108,B110,B111,B119,B123,B124,B127,B130,B131,B137,B14,B140,B15,B20,B27,B29,B32,B4,B43,B5,B50,B51,B55,B59,B6,B60,B63,B69,B7,B72,B76,B77,B80,B83,B86,B88,B9,B99,C16,C17,C23,C24,C25,C28,C37,C39,C47,C49,C61,C67,C7,C73,C75,C77,D1,D3
`Chr1:70745128`	`A`	`AGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	64	A10,A4,A6,B1,B101,B103,B105,B107,B108,B110,B111,B119,B123,B124,B127,B130,B131,B137,B14,B140,B20,B27,B29,B32,B4,B43,B5,B51,B55,B59,B6,B60,B63,B69,B7,B72,B76,B77,B80,B83,B86,B88,B9,B99,C16,C17,C23,C24,C25,C28,C37,C39,C47,C49,C61,C67,C7,C73,C75,C77,C84,C86,D1,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788691.1

489 aa

244

489

Transferase

PF02458 Transferase 11-483 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788691.1`	Pfam	`PF02458`	Transferase	Family	11	483	6.7e-104	348.7	Transferase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932708.1
CTCCCCATTCTCCCACACTCACTCACACTCCAAATATACATACATACATATATATGAAGATAATGGTTTCCCAATCGCTGCCAATTGTCTCGAAATGCAGAGTTTCCCCCTCCCAAAAATCCACCCTAACGGAGCTCAAGCTCTCCGTCTCCGACCTCCCCATGCTCTCCTGCCACTATATCCAGAAAGGCGGCTTGTTCGCCAAGCCTCCATTCCCCATCTCCGACCTCCTCTCTCTCCTCAAACGCAGCCTCTCGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005676
ATGAAGATAATGGTTTCCCAATCGCTGCCAATTGTCTCGAAATGCAGAGTTTCCCCCTCCCAAAAATCCACCCTAACGGAGCTCAAGCTCTCCGTCTCCGACCTCCCCATGCTCTCCTGCCACTATATCCAGAAAGGCGGCTTGTTCGCCAAGCCTCCATTCCCCATCTCCGACCTCCTCTCTCTCCTCAAACGCAGCCTCTCGCACTCGCTCACCCACTTCCCGCCCCTCGCCGGCCGCCTCACCACCGACGCGGCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788691.1
MKIMVSQSLPIVSKCRVSPSQKSTLTELKLSVSDLPMLSCHYIQKGGLFAKPPFPISDLLSLLKRSLSHSLTHFPPLAGRLTTDAAGYVYIHCNDEGVDFIHANASHIHVIDLLGSADGDVPEAVKSCFAFDHAVSHTGHFRPLLAVQVTELADGVFIACSFNHAVADGTSFWNFFNTFAELSRSGVKRISRSPDFSRDSVLISSAVLRLPEGGPKVTFSGDAPIRERIFRFSRESILKLKARVNNGNMMITNGAVNVAE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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