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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005351`

染色体: Chr01 坐标: 70754586-70757176 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005351`
名称	SmilChr01G005351
描述	SNW/SKI-interacting protein A
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70754586 - 70757176 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005679`
GeneID	`131005679`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005679`
原始查询	`SmilChr01G005351`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	SNW/SKI-interacting protein A
产物	SNW/SKI-interacting protein A
Arabidopsis	`AT1G77180` (SKIP) chromatin protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844055] identity=70.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0759800` (OsSKIPa) - identity=70.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005681 (spliceosomal complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02731 (SKIP_SNW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005679

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788694.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057788694.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788694.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788694.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788694.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70754961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B70
`Chr1:70755066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:70755179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C47,C82
`Chr1:70755203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:70755252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr1:70755831`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B19,B95
`Chr1:70755942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C44
`Chr1:70756131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:70756334`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,C48,D2,D4
`Chr1:70756352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:70756452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,D5
`Chr1:70756475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788694.1

608 aa

304

608

SKIP_SNW

PF02731 SKIP_SNW 186-345 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788694.1`	Pfam	`PF02731`	SKIP_SNW	Family	186	345	7.4e-73	244.2	SKIP/SNW domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932711.1
GGATTGACTTATTTTGCATTTATTTTAATTTATTTTTTGGATAAAAGGAAAGTGGGTGTTATTGTTTGGATACGGATAATATGAGTACATGATGGCCTCCTTATCCTTGTTAAATTAAAACCTGTTTATAGAAACCCCGTAACCAAACCAAACGCTATTTTCCACTTCGCCTTTAATCATCGCCGACCCTAATCAGATCAGTATCGATTTGCAACGACAAAGGCGGAGTTTGACCGGATCTTCGAGTCGGAGAAATTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005679
ATGGCGGCGTTGACAGACATTCTTCCGAAGGCGAAATCGTCGGTTAATAGTAATTATGATCACTCTAACGATCCCTGGTTTAAAAGCCGGTATAGTTTATCGGAGGTGGAGGAGGATTATGTAGCTGTGAAGGCTAAGCCAGTCCCTCCTTATCTGAAACGGGCAGGGTTTAAGCCATCGAAGCCCGAGGACTTTGGGGATGGAGGGGCGTTCCCTGAAATTCATTATGCGCAGTACCCACTTGGGATGGGGAGGAGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788694.1
MAALTDILPKAKSSVNSNYDHSNDPWFKSRYSLSEVEEDYVAVKAKPVPPYLKRAGFKPSKPEDFGDGGAFPEIHYAQYPLGMGRSKSKPGAKTLPLTVDERGNLRYDTIVRQDENAKKIVYSQHSDLVPVFAKDDAKEDDMDVDEKQKEIDETTQQTKAALEQIVNVRLSAAQPKNVPKQSSDSKFIKYKPSQQSAAFNSGAKERIIRMVEMPVDPLEPPKFKHKRVPKASGSPPVPVMHSPPRPVTVKDQQDWKIPPC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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