当前解析结果
SmilChr01G005352| 统一新 Gene ID | SmilChr01G005352 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G005352 |
| 描述 | WUSCHEL-related homeobox 5-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 70761623 - 70762866 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131005681 |
|---|---|
| GeneID | 131005681 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131005681 |
| 原始查询 | SmilChr01G005352 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | WUSCHEL-related homeobox 5-like |
| 产物 | WUSCHEL-related homeobox 5-like |
| Arabidopsis | AT3G11260 (WOX5)WUSCHEL related homeobox 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820297] identity=57.7; qcov=1.12; evalue=8.1e-60; confidence=high |
| Rice | Os01g0854500 (OsWOX9)- identity=77; qcov=0.474; evalue=2.09e-35; confidence=medium |
| GO | GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0099402 (plant organ development) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00046 (Homeodomain) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131005681 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057788695.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057788695.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057788695.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057788695.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057788695.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:70761893 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B74,B90 |
Chr1:70762526 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B59 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057788695.1PF00046
Homeodomain 19-79 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057788695.1 |
Pfam | PF00046 |
Homeodomain | Domain | 19 | 79 | 1.9e-14 | 53.9 | Homeodomain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。