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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005354`

染色体: Chr01 坐标: 70772397-70776049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005354`
名称	SmilChr01G005354
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70772397 - 70776049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005684`
GeneID	`131005684`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005684`
原始查询	`SmilChr01G005354`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
产物	eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F
Arabidopsis	`AT2G39990` (EIF2) eukaryotic translation initiation factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818587] identity=75; qcov=1.03; evalue=1.07e-147; confidence=high
Rice	`Os05g0104800` (EIF3F) - identity=76.9; qcov=0.961; evalue=1.26e-158; confidence=high
GO	GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0006413 (translational initiation); GO:0008237 (metallopeptidase activity); GO:0031369 (translation initiation factor binding); GO:0071541 (eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m)
KEGG	-
Pfam	PF01398 (JAB); PF13012 (MitMem_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788698.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788698.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788698.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788698.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70772651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A23,B101,B104,B46
`Chr1:70774484`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr1:70775663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:70775800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A5,B51,C25

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788698.1

284 aa

142

284

JAB

MitMem_reg

PF01398 JAB 19-121 aa PF13012 MitMem_reg 171-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788698.1`	Pfam	`PF01398`	JAB	Domain	19	121	2e-26	92.8	JAB1/Mov34/MPN/PAD-1 ubiquitin protease
`XP_057788698.1`	Pfam	`PF13012`	MitMem_reg	Family	171	278	1.5e-30	106.1	Maintenance of mitochondrial structure and function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932715.1
AACATCACAAAGAAAAACGCTAATTTTTTTTTACTATCATCCAATAAGGCCCAAATTATTGACCCGTTTAACCCAGCCCTAATTTAAACGGCCCAATTTCTCGAAGTGCTGACCCATTCCTCTTTCAATTTTTGGTGAAATCCTAAAACCCTAGAATTCCTCTCCCTCTCTCCACACACATCCAGCTGCACTGCACCGTCGGAGAAATGGGATCTAGCGGACAAACGGTGCTGCAGTATGTACCATCACCGGCAAGCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005684
ATGGGATCTAGCGGACAAACGGTGCTGCAGTATGTACCATCACCGGCAAGCGTGTCGGCTAAGGTTCATCCGCTTGTTATTTTCAATATCTGCGATTGTTACGTGAGGCGGCCGGACCAAGCCGAGCGCGTCATCGGCACGCTACTCGGCTCCGTTTTGCCCGACGGCACCGTCGACATTCGCAATTCCTACGCCGTTCCCCACAATGAATCCTCGGATCAGGTTGCACTTGATATTGATTATCATCAGAATATGTTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788698.1
MGSSGQTVLQYVPSPASVSAKVHPLVIFNICDCYVRRPDQAERVIGTLLGSVLPDGTVDIRNSYAVPHNESSDQVALDIDYHQNMLTSHQKVNPKEIIVGWFSTGGVIGGSALIHEFYSREVNNPIHLTVDTEFRTGNASIKAFVSVALSLGDQQLAAQFQEIPLDLRMVEAEQIGFDVLKPTIVDKLPNDLEGMEASMGRLLALIDDVYKYVDDVVEGRTAPDNKIGRFISDTIAALPKLSPNAFDKLVNDSLQDQLLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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