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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005363`

染色体: Chr01 坐标: 70861736-70865267 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005363`
名称	SmilChr01G005363
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g56420-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70861736 - 70865267 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005693`
GeneID	`131005693`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005693`
原始查询	`SmilChr01G005363`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g56420-like
产物	F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g56420-like
Arabidopsis	`AT5G56420` (AT5G56420) F-box/RNI-like/FBD-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835743] identity=28.2; qcov=0.92; evalue=2.14e-21; confidence=low
Rice	`Os07g0163200` (OsFbox344) - identity=29.7; qcov=0.901; evalue=5.78e-43; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF08387 (FBD); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005693

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788707.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788707.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788707.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788707.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788707.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70862753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B93,C51,C70
`Chr1:70862799`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A24,B15,B27,B35,B67,B86,C16,C27,C35,C36,C41,C44,C63,C79
`Chr1:70862953`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:70863170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B135,B52,C30,C57
`Chr1:70863219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B139
`Chr1:70863257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:70863494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C5
`Chr1:70863509`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B73,C2,C33,C87
`Chr1:70863515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70863516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70864821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788707.1

463 aa

232

463

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

FBD

PF00646 F-box 20-57 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 94-461 aa PF24758 LRR_At5g56370 118-229 aa PF08387 FBD 378-419 aa

XP_057788708.1

463 aa

232

463

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

FBD

PF00646 F-box 20-57 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 94-461 aa PF24758 LRR_At5g56370 118-229 aa PF08387 FBD 378-419 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788707.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	20	57	1.6e-08	34.8	F-box domain
`XP_057788707.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	94	461	3.8e-37	129.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057788707.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	118	229	1.3e-13	51.9	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057788707.1`	Pfam	`PF08387`	FBD	Repeat	378	419	1.8e-11	44.4	FBD
`XP_057788708.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	20	57	1.6e-08	34.8	F-box domain
`XP_057788708.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	94	461	3.8e-37	129.3	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057788708.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	118	229	1.3e-13	51.9	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats
`XP_057788708.1`	Pfam	`PF08387`	FBD	Repeat	378	419	1.8e-11	44.4	FBD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932724.1
AATGCTGCTGTTATTAAAACTCAATTGATGGTGGCTTTATCAGGCCCATGTCGAAAGGTTTGTGTATCTCCAAATTTCTTCCATATTTCCTCGTGGTGTTTTACTCTCGTCTCAGCTTTGAGAATCTCAATATAGATTACAATAGCTGCTGTATCGGCGGCTTCAATGAGGAAAAGAGCGCGGCTTACAGAACCTAAGGAGCTGTTTAATGCGGATGATTGCATCAGTGCATTGCCGGATGATCTTCTGGTTACGATCTT...

XM_057932725.1
ATGTCGAAAGGTAATTAAGACAATAGGTGTCGTAAAAATTTCCAGATATTAAGCTTTAATGTGATAGTTATAATTCTAATATTCCGCGAAAATCTCACTTTTTGGGGAGGAAGAAAATCGTGATAATTTATAAAACTCACAACCGTGTTTAATCAGTAATTTTTCTTAGGTTTGTGTATCTCCAAATTTCTTCCATATTTCCTCGTGGTGTTTTACTCTCGTCTCAGCTTTGAGAATCTCAATATAGATTACAATAGCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005693
ATGAGGAAAAGAGCGCGGCTTACAGAACCTAAGGAGCTGTTTAATGCGGATGATTGCATCAGTGCATTGCCGGATGATCTTCTGGTTACGATCTTATCATGTTTAACGCTCAAGGAAGCTGCTGTTACTAGTATTCTGTCAAGGCGATGGCGGCATTTATGGACTAATGTAGCTGGATTAGATTTTGATGCTAATGACACATTGGATAATATTGCTGCTGACCCCAAATTAAGGAGCTCCGAGAGGCCAAAATACATTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788707.1
MRKRARLTEPKELFNADDCISALPDDLLVTILSCLTLKEAAVTSILSRRWRHLWTNVAGLDFDANDTLDNIAADPKLRSSERPKYINWVNRVVRQHRGPTLDAVRICFDLDKSSRSAIDNWVKFAIAKRVQRLELDLLENGETLRQPTRNYTFPYKPLSQSKGSSLKNVYSNLALTQPSMSTGLKCLKALSLKCVNVSEEALDCFLSTCLVLQYLSIHGSGGLKNVKVTGFELPLKYLEIVFCLGIDTIEISNVNLVSFS...

XP_057788708.1
MRKRARLTEPKELFNADDCISALPDDLLVTILSCLTLKEAAVTSILSRRWRHLWTNVAGLDFDANDTLDNIAADPKLRSSERPKYINWVNRVVRQHRGPTLDAVRICFDLDKSSRSAIDNWVKFAIAKRVQRLELDLLENGETLRQPTRNYTFPYKPLSQSKGSSLKNVYSNLALTQPSMSTGLKCLKALSLKCVNVSEEALDCFLSTCLVLQYLSIHGSGGLKNVKVTGFELPLKYLEIVFCLGIDTIEISNVNLVSFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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