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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005369`

染色体: Chr01 坐标: 70908005-70913533 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005369`
名称	SmilChr01G005369
描述	uncharacterized SmilChr01G005369
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70908005 - 70913533 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005698`
GeneID	`131005698`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005698`
原始查询	`SmilChr01G005369`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827625]; symbol=AT4G18905; hit=AT4G18905; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827625]; symbol=AT4G18905; hit=AT4G18905; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G18905` (AT4G18905) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827625] identity=62.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0924300` (OsWD40-29) - identity=55.9; qcov=0.996; evalue=1.3e-170; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006364 (rRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005698

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788717.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057788717.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057788717.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057788717.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788717.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70908655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B133,B84,D3
`Chr1:70908725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr1:70908954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B98,C52,D7
`Chr1:70908968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:70908988`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C16
`Chr1:70908988`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C16
`Chr1:70908999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70909286`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:70909307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:70909311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,D10,D11
`Chr1:70909363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:70910487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788717.1

490 aa

245

490

WD40

PF00400 WD40 255-286 aa PF00400 WD40 291-326 aa PF00400 WD40 385-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788717.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	255	286	1.2e-25	89.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788717.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	291	326	1.2e-25	89.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057788717.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	385	423	1.2e-25	89.5	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932734.1
GGCCCAAACCTCTTTTTCTTTTCTCTCCCTCGCGCCGTCTTCCAAAACCTTCCCATTCTTCCGGGCTTCTTCTCAATTACTTCCGCCTCCTCCTCCTCGCCGACCGCCACCTATCGCATCTCGCCAGCCGCCGCCGAGTGATTTTTATCAAGAATGATTGCCGCCATCTCCTGGGTTCCGAAAGGAATTGCAAATTCAGTACCTACTGCAGCAGACCCCCCTTCCAAAGAAGAAATTGAAGAGATTGTAAAGAGTGGTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005698
ATGATTGCCGCCATCTCCTGGGTTCCGAAAGGAATTGCAAATTCAGTACCTACTGCAGCAGACCCCCCTTCCAAAGAAGAAATTGAAGAGATTGTAAAGAGTGGTCTTCTGGATCCTCGCGAAGAGAGTGAAAATGAGGAAAATGATGAAAATATGAATGATGATGATGATGATGAACTCAGTCAAAATAATGAACTTTCTCACGCGTTATCTGCTGCTAATGCACTTGGAAAAGTTCTCAAGACTGGAAATCCAGAAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788717.1
MIAAISWVPKGIANSVPTAADPPSKEEIEEIVKSGLLDPREESENEENDENMNDDDDDELSQNNELSHALSAANALGKVLKTGNPETDILSEALKELDMDNYDEEDDGVELFGSSNLYYASNKMDPYLKDGDEDSEEEEDMTIKPEDGIIVCARNEDDVSHLEVWILEDPSDVNSNMYVHHDIVIPAFPLCTAWLDCPLKGGEKGNFIAVGSMEPAIEIWDLDIMDEVQPSATLGGVAEKKKKGKKKSIKYKDGSHTDSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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