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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005371`

染色体: Chr01 坐标: 70915528-70921486 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005371`
名称	SmilChr01G005371
描述	protein SMAX1-LIKE 6-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70915528 - 70921486 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005699`
GeneID	`131005699`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005699`
原始查询	`SmilChr01G005371`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SMAX1-LIKE 6-like
产物	protein SMAX1-LIKE 6-like
Arabidopsis	`AT1G07200` (AT1G07200) Double Clp-N motif-containing P-loop nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837231] identity=36.8; qcov=1.03; evalue=9.27e-172; confidence=medium
Rice	`Os11g0104300` (D53) - identity=38.7; qcov=0.669; evalue=7.16e-94; confidence=medium
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF02861 (Clp_N); PF07724 (AAA_2); PF23569 (NBD_SMAX1); PF26587 (AAA_lid_SMAX1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005699

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788718.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788718.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788718.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788718.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057788718.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70916795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:70916797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:70916814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B108,B114,B46,C23
`Chr1:70916820`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr1:70917005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:70917099`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,C40,C75
`Chr1:70917122`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C52,D7
`Chr1:70917130`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:70917137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C11,C47,C69,C8
`Chr1:70917190`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70917322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B108,B114,B46,C23
`Chr1:70917387`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	100	A11,A13,A14,A18,A19,A2,A25,A3,A4,A9,B1,B10,B101,B102,B106,B107,B108,B111,B114,B119,B120,B124,B126,B127,B128,B13,B137,B14,B140,B16,B17,B2,B23,B26,B28,B3,B33,B34,B46,B47,B51,B53,B54,B63,B65,B66,B67,B7,B70,B71,B73,B74,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B87,B91,B93,B95,B97,B98,C1,C12,C14,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C31,C34,C40,C42,C43,C49,C5,C52,C53,C56,C57,C59,C6,C62,C74,C76,C77,C81,C83,C84,D1,D5,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788718.1

993 aa

496

993

Clp_N

NBD_SMAX1

AAA_2

AAA_lid_SMAX1

PF02861 Clp_N 42-144 aa PF23569 NBD_SMAX1 261-418 aa PF07724 AAA_2 647-778 aa PF26587 AAA_lid_SMAX1 893-972 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788718.1`	Pfam	`PF02861`	Clp_N	Family	42	144	5.9e-07	30.5	Clp repeat (R) N-terminal domain
`XP_057788718.1`	Pfam	`PF23569`	NBD_SMAX1	Domain	261	418	6.2e-12	46.5	SMAX1 nucleotide binding domain
`XP_057788718.1`	Pfam	`PF07724`	AAA_2	Domain	647	778	1.5e-09	38.8	AAA domain (Cdc48 subfamily)
`XP_057788718.1`	Pfam	`PF26587`	AAA_lid_SMAX1	Domain	893	972	1.3e-19	70.5	SMAX1-like, AAA+ ATPase lid domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932735.1
CCAAGATATGTCATGTATTTTTCCTTTTATTTATTTACATAACTTCTCGTTGACATAAATTACATAGAAAACGACCCGACAAAAGTAAGAAATCAAATAAACTAACACAACAGTATATGATAAATGCTAAACATAAATATAATTATATTATTAATCAATGATGTATTTCATTAATTTCAGATAAATTTGTCATCAATATAATTTTTTACTCTATTTTTTGTGTAAAAATCAGAAGTAAAAGAAAATTTAAAATAATCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005699
ATGTTACATTTATTTAATAATAATCAACCATTAAATTACTACTACTACTCCTTTTTATTTCCTTTTTCCGCTCTTTTTTTGTGGAAGCAAATGCCGACGCCCGTGGCCGCCGCGAGGCAATGCCTCACGCAGGAGTCGGCCGCCGTCCTCGATGACGCCGTGGGCGTGGCGCGCCGCCGCGGCCACGCGCAGACGACCTCCCTCCACATGGTCTCCTCCCTCCTCTCCCTCCCGAGCTCCTCCCTCCGCGAGGCATGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788718.1
MLHLFNNNQPLNYYYYSFLFPFSALFLWKQMPTPVAAARQCLTQESAAVLDDAVGVARRRGHAQTTSLHMVSSLLSLPSSSLREACSRTRSNAYSTRVQFKALELSLSVSLDRLPSSPAAKHDEPPVSNSLMAAIKRSQANQRRQPENFSFYQQQQQQQFSAAPLVKVELQNLIVSILDDPLVSRVFGEAGFRSCDIKMATLRPGIGSFQVLGCTSRYKRPSPPLFLCNLTASEGDHAGINGGKGFSFPFMGCFAGDDTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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