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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005373`

染色体: Chr01 坐标: 70956789-70962209 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005373`
名称	SmilChr01G005373
描述	uncharacterized SmilChr01G005373
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70956789 - 70962209 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005702`
GeneID	`131005702`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005702`
原始查询	`SmilChr01G005373`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824762]; symbol=AT3G55960; hit=AT3G55960; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824762]; symbol=AT3G55960; hit=AT3G55960; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G55960` (AT3G55960) Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824762] identity=65.2; qcov=1; evalue=5e-145; confidence=high
Rice	`Os01g0833100` - identity=58.1; qcov=1.03; evalue=1.71e-130; confidence=high
GO	GO:0004721 (phosphoprotein phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03031 (NIF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005702

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057788723.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057788723.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057788723.1`
4	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057788723.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788723.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70957327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B94
`Chr1:70957343`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:70957352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:70957401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:70958945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr1:70961776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,B80,C26,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788723.1

316 aa

158

316

NIF

PF03031 NIF 110-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788723.1`	Pfam	`PF03031`	NIF	Family	110	292	4.4e-42	144.2	NLI interacting factor-like phosphatase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932740.1
TAGTAGACAGAAACGAAAAATTAAATACAACTGTATTGATAATAAATTAATAATGCTACTTAATCTTTCTTTTTATGTTTTCACTTACCCCAGTCTCACTCGTAACGCGTGGCGAAGACTCGCTCCCCTCATTTTAATTTCATTTACATTTTATGTATCTGGACCTTGATCGCAATAACCATCGCCTCCATCCTGACCACTCCTCTCCGTCGCCTCTGAAAACACACACCACACACACTCTCTCTCTCACTCTCACGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005702
ATGGCGGAGCTGGCGGCGGCTGAAGTCTACGCGCCGCGGACGCTGCAGGTGTGGCGGACGCTCCTCAACTGGCTGGCGTTCTTCTTCCAGATCTTCGCGCAGATCCTCCGCGGCACGCCGTCGTTCACTCAGGTCCTCTCGTATGTTGGCCTGCGCCAGGGGTCGTTTCTGTCTTCCGCGCCCCACGCGCCGCCGCAGTTCAAGCCTCTGCCGGTGGTCGAGCTTCCGGAGTACTCGGAGGAGCCTGAGGAGGCACCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788723.1
MAELAAAEVYAPRTLQVWRTLLNWLAFFFQIFAQILRGTPSFTQVLSYVGLRQGSFLSSAPHAPPQFKPLPVVELPEYSEEPEEAPPPQLTSPVHGGGEGAADSPPFGKLTVVLDLDETLVCAYETSSLPAMLRSQATEAGIKWFELECISSDKEFEGKPKINYVTVFERPGLKEFLKQLSEFADLILFTAGLEGYARPLVDKIDSTNLFSRRLYRPSTISTEYREHVKDLSSLSKDFCRIVIVDNNPFSFLLQPLNGIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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