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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005374`

染色体: Chr01 坐标: 70968028-70970769 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005374`
名称	SmilChr01G005374
描述	putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	70968028 - 70970769 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005703`
GeneID	`131005703`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005703`
原始查询	`SmilChr01G005374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
产物	putative serine/threonine-protein kinase-like protein CCR3
Arabidopsis	`AT3G55950` (CCR3) CRINKLY4 related 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824761] identity=58.5; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0127300` (OsCRR3) - identity=44.8; qcov=0.926; evalue=7.98e-170; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005703

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057788724.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788724.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788724.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788724.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:70968237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B126,B71,B78,C62
`Chr1:70968248`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr1:70968361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:70968372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:70968377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C71
`Chr1:70968421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr1:70968499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B125,C44,C77,D3
`Chr1:70968568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,C65
`Chr1:70968927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr1:70968942`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,D10,D11
`Chr1:70968973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B103
`Chr1:70968974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788724.1

786 aa

393

786

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 482-759 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 482-762 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788724.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	482	759	1e-41	143.8	Protein kinase domain
`XP_057788724.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	482	762	2.2e-42	145.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932741.1
AAAAACCTCTAAATCTAGAGAATAGGATTTAGATTTTAGATAAAGAAAAGAAAGGCAGCTCTTTGCTAACTAAAATGCAACTCTTGACCTTCTCTCTCTATACTCTGTTTCTCTCTCTAGAGTAGTTGTCCATTCTCTCTCTACGAATGAGGGGATACTGCCATTATTCCCGAACAATCCAAGCGCCATTTAGATGACGACGCCGTTTTCAGCCGTCATCGCCGCCTCATTATTAATCCTCTTCGCCCTACGCCCTCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005703
ATGACGACGCCGTTTTCAGCCGTCATCGCCGCCTCATTATTAATCCTCTTCGCCCTACGCCCTCCTCCGCCCTCCGCCCATGCACTGGGCGGCTCCGCCGCCACCGTCGCCGTAGTCTACGGCTCCGCCACCACCATCTGCACCATAACCGCGCAGCCGCCCGTCCAACAAATCCAATGCTGGAGGAACGGCCTCCTCCTGCCGCCCATCCTCCCCAACACCTCCTTCGACGCCGTCGCCGGCGGCAGAGACACTCTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788724.1
MTTPFSAVIAASLLILFALRPPPPSAHALGGSAATVAVVYGSATTICTITAQPPVQQIQCWRNGLLLPPILPNTSFDAVAGGRDTLCGVRSGGFSLLCWNTTFAPKRIYNNASAPLTSLTVGATQICALRNVSSSESDNAICWRQNSASSPHIPRYSQFRVISSGLLFSCGVTRIGNRVLCWGDDAISNSIQSELQNYSMLNIQVGGKFACGINVTGYIICKGSNDSGQLNTPLETARDFSGVAVGANHGCAIRKTNGAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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