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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005381`

染色体: Chr01 坐标: 71042821-71045287 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005381`
名称	SmilChr01G005381
描述	uncharacterized SmilChr01G005381
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71042821 - 71045287 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005710`
GeneID	`131005710`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005710`
原始查询	`SmilChr01G005381`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Alpha/beta hydrolase related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818598]; symbol=AT2G40095; hit=AT2G40095; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Alpha/beta hydrolase related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818598]; symbol=AT2G40095; hit=AT2G40095; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G40095` (AT2G40095) Alpha/beta hydrolase related protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818598] identity=64; qcov=1.04; evalue=1.03e-85; confidence=high
Rice	`Os01g0647700` - identity=44.8; qcov=0.932; evalue=7.95e-36; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10457 (MENTAL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005710

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057788733.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057788733.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057788734.1`
4	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057788733.1`
5	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057788734.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71043149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:71043176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr1:71043196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B125,B28
`Chr1:71043275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B74,C76,C77
`Chr1:71043289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B28,B52
`Chr1:71043307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B32
`Chr1:71043309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C53
`Chr1:71043310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C76,C77,D8
`Chr1:71043582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71043645`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B122,B99
`Chr1:71043816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:71043819`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A20,B115,B18,B48,B58,B64,B83,C37,C80,C83,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788733.1

230 aa

115

230

MENTAL

PF10457 MENTAL 66-174 aa

XP_057788734.1

206 aa

103

206

MENTAL

PF10457 MENTAL 66-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788733.1`	Pfam	`PF10457`	MENTAL	Domain	66	174	1.8e-06	28.6	Cholesterol-capturing domain
`XP_057788734.1`	Pfam	`PF10457`	MENTAL	Domain	66	162	4.2e-07	30.6	Cholesterol-capturing domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009095337.1
ACCACACTCAAGTTTTTCGGTATTGCAGTTAAAAAGCTTTTCTAGAGAGAGAGAACCCTAGAGAGAGAAGAAGACCAAGTAGCCTCCCCTATTTGACCACTCCCTTTCGCGAATACATTTCCGAACTCACACAATATTTTGCAGTCAATTCTTCCCTGCGTTTCTCAATTCCGCTCTCTCGCCTCTTTCCACTCACCTTCTCTCTCATCCCCCCTTTTCTCCCTCTCGGAATCACAATTCACAACGCACACACACGCACA...

XM_057932750.1
TCGGTATTGCAGTTAAAAAGCTTTTCTAGAGAGAGAGAACCCTAGAGAGAGAAGAAGACCAAGTAGCCTCCCCTATTTGACCACTCCCTTTCGCGAATACATTTCCGAACTCACACAATATTTTGCAGTCAATTCTTCCCTGCGTTTCTCAATTCCGCTCTCTCGCCTCTTTCCACTCACCTTCTCTCTCATCCCCCCTTTTCTCCCTCTCGGAATCACAATTCACAACGCACACACACGCACACTGAGAGCAGAGCGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131005710
ATGGGATTCTCCAAGGATGAAAAAACGTACGGCAAGGCGGCGCTCGCGGTTCCGAGATGGATCAAAACCCTATTCTTCCTGATCACGATGCTGCTGTCTCTGCTCCTATTCTCCGCCCCGGTTCTCCTCGTCGTCGCCGACGCGCTCCTCCCCTCCGCCTTCCTGTCCGCCGCCATGTCGCCGTCGTCCCTCAACCTCCAGACGCTATCCTCCCACCTCAGCAACTACGACTTCCGCTACTCGCTCATCGATATCCCCCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057788733.1
MGFSKDEKTYGKAALAVPRWIKTLFFLITMLLSLLLFSAPVLLVVADALLPSAFLSAAMSPSSLNLQTLSSHLSNYDFRYSLIDIPLVSIVRSAVILCVYSFCDGPRLSRGPYLAIATVCSAASLVYVSLKASYVFMISGRSAGAMEMALFVSSWVLAIGHVVVAYRTSCRERRKLLVYKIDIEAVSQFPHLNLYFSTRGFLVIPPPAFFYLFSEFESAICVFSRLANTQ

XP_057788734.1
MGFSKDEKTYGKAALAVPRWIKTLFFLITMLLSLLLFSAPVLLVVADALLPSAFLSAAMSPSSLNLQTLSSHLSNYDFRYSLIDIPLVSIVRSAVILCVYSFCDGPRLSRGPYLAIATVCSAASLVYVSLKASYVFMISGRSAGAMEMALFVSSWVLAIGHVVVAYRTSCRERRKLLVYKIDIEAVSACKNGFPRYQKILQEARTK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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