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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005382`

染色体: Chr01 坐标: 71056389-71062801 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005382`
名称	SmilChr01G005382
描述	jasmonate-induced oxygenase 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71056389 - 71062801 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005711`
GeneID	`131005711`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005711`
原始查询	`SmilChr01G005382`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	jasmonate-induced oxygenase 2
产物	jasmonate-induced oxygenase 2
Arabidopsis	`AT5G05600` (AT5G05600) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830443] identity=64.9; qcov=0.98; evalue=1.28e-173; confidence=high
Rice	`Os05g0127500` (P0683F12.14) - identity=59.9; qcov=0.969; evalue=7.2e-150; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005711

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788735.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057788735.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788735.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788735.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788735.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71056676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,C17,C36,C64,C66
`Chr1:71056795`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr1:71056795`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr1:71060929`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C43
`Chr1:71060929`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C43
`Chr1:71062180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B76,C66,D7
`Chr1:71062191`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B49
`Chr1:71062215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C85
`Chr1:71062239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C85
`Chr1:71062239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:71062456`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B30,C21,C30
`Chr1:71062512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788735.1

355 aa

178

355

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 54-161 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 210-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788735.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	54	161	2.6e-31	109.4	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057788735.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	210	308	6.1e-34	117.1	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932752.1
ATTTAAACCTTTCGCCATTCATCAAAAAAAGCCACTAAAGGTAAATCGACACACCACAAGAGCCCCTTGTCCGCCACAAGAATATCATACACTAATTTCACGTTCTCTTCTCTCATGTCAACTTCACCACCCATCCTCATCTCTTCTACTCCCTATTATACACATTTTCTTTATTTATATTTAAATCCCATATATTCACTCTAGCTCTATATATACACACACACATATGAAGTCGATTTTTGGTATTGAGATACATACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005711
ATGCATATGACGATGGCCTGCCCAAGCGACTGGCCGGAGCCCATAGTCCGAGTCCAATCCCTATCGGAAGCGTGCGCCAAGATTCCGGAGCGCTACGTCAAGCCGCTCGAGTCGCGCCCTTCCTTGAAGCAGATCACGGGTGGTGCGGGCGAGGTGAACATACCGGTGATCGACCTGGGCGGGCTCCACCACGACGGCGGCGCGACGATGGCGCGTGTGGCGGAGGCGTGCCGCGACTGGGGTTTCTTCCAGGTGGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788735.1
MHMTMACPSDWPEPIVRVQSLSEACAKIPERYVKPLESRPSLKQITGGAGEVNIPVIDLGGLHHDGGATMARVAEACRDWGFFQVVNHGVRAELMDQAQEVWRQFFHQPMELKQAYANSPATYEGYGSRLGVEKAAILDWSDYYFLHYLPCNLRDYNKWPSLPISLREAMDEYSREIVRLGGVLLKILSISLGLRQDFLQNSFGGEDVGACLRVNFYPKCPEPDLTLGLSPHSDPGGMTFLLPDRNVPGLQVRRGNQWIT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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