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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005384`

染色体: Chr01 坐标: 71121235-71123322 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005384`
名称	SmilChr01G005384
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71121235 - 71123322 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005713`
GeneID	`131005713`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005713`
原始查询	`SmilChr01G005384`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
产物	F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g26920-like
Arabidopsis	`AT1G80960` (AT1G80960) F-box and Leucine Rich Repeat domains containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844436] identity=23.9; qcov=0.912; evalue=6.67e-13; confidence=weak
Rice	`Os11g0533800` (OsFbox602) - identity=26.1; qcov=0.974; evalue=2.51e-16; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF23622 (LRR_At1g61320_AtMIF1); PF24758 (LRR_At5g56370)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005713

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788738.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057788738.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788738.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788738.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788738.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71121383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C47,C8
`Chr1:71121399`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C8
`Chr1:71121399`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C8
`Chr1:71121402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr1:71121417`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:71121471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr1:71121479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B51,B6,C65,D7
`Chr1:71121491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B137,C75,C78
`Chr1:71121494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr1:71121543`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C70
`Chr1:71121543`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C70
`Chr1:71121560`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788738.1

467 aa

234

467

F-box

LRR_At1g61320_AtMIF1

LRR_At5g56370

PF00646 F-box 25-62 aa PF23622 LRR_At1g61320_AtMIF1 115-421 aa PF24758 LRR_At5g56370 154-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788738.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	25	62	2.8e-06	27.7	F-box domain
`XP_057788738.1`	Pfam	`PF23622`	LRR_At1g61320_AtMIF1	Repeat	115	421	1.4e-18	68.1	At1g61320/AtMIF1, LRR domain
`XP_057788738.1`	Pfam	`PF24758`	LRR_At5g56370	Repeat	154	242	5.6e-09	36.7	FBD-associated F-box protein At5g56370, LRR repeats

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932755.1
GCGACGACCACCTCCCCTGATTTACTAAGAAAGATCGTTGCTTGAACCGCCGATCTCAATAAGAGTTGAGGTGTTTGCAGAAGAAAGATTGAAAAAGCTAAAGTTATCATCTTTTTTAATGGAACGGACTCCTTGTCAGCAGGGTATATATGGTACTAATAAACAGTCACCCAGTGATAATGCCGACATTGATAAGTTGGCTGATGAATTACTAGTTCACATTCTGTCTCGCATGAGCCTCAAGGAAGCTGCAAGGACTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005713
ATGGAACGGACTCCTTGTCAGCAGGGTATATATGGTACTAATAAACAGTCACCCAGTGATAATGCCGACATTGATAAGTTGGCTGATGAATTACTAGTTCACATTCTGTCTCGCATGAGCCTCAAGGAAGCTGCAAGGACTTGCATCCTTGCGCGTAGATGGAGATATTTATGGAGGTCTGTATCTGGAACCTTGCAATTTGATGTTAGGGATTTTGTGACTGCCGCTGGAGATGGAATGGAAGTGGAGAAGTTTGTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788738.1
MERTPCQQGIYGTNKQSPSDNADIDKLADELLVHILSRMSLKEAARTCILARRWRYLWRSVSGTLQFDVRDFVTAAGDGMEVEKFVSWVNTVLELHQGRYIEGIVVIFCLGMNEKQLETIHTARIARVVDSWVYAAVQKELERFELHLPWATHHKFPSIEMLKSHSHRGSNSSPFRRLKILRLLEVPIEDEVVHYFLASCPNLEQLFIYHSDDTKNIRVVDPPSLRVLEIKSWYLESLEISAESLVSLAHVAPRICDLKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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