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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005389`

染色体: Chr01 坐标: 71179525-71182556 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005389`
名称	SmilChr01G005389
描述	uncharacterized SmilChr01G005389
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	71179525 - 71182556 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005718`
GeneID	`131005718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005718`
原始查询	`SmilChr01G005389`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768790]; symbol=AT3G07030; hit=AT3G07030; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768790]; symbol=AT3G07030; hit=AT3G07030; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G07030` (AT3G07030) Alba DNA/RNA-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768790] identity=62.8; qcov=0.516; evalue=4.71e-60; confidence=medium
Rice	`Os03g0166000` - identity=74.2; qcov=0.456; evalue=1.24e-58; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01918 (Alba); PF12328 (Rpp20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057788750.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057788750.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057788750.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057788750.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:71181292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B49,B76,B81,C3
`Chr1:71181495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:71181599`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:71181649`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71181651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:71182372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B139,C51,C71,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788750.1

281 aa

140

281

Alba

Rpp20

PF01918 Alba 19-76 aa PF12328 Rpp20 41-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788750.1`	Pfam	`PF01918`	Alba	Domain	19	76	1.6e-17	63.7	Alba
`XP_057788750.1`	Pfam	`PF12328`	Rpp20	Family	41	111	1.7e-07	31.9	Rpp20 subunit of nuclear RNase MRP and P

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932767.1
AAAGAACTAATTTTTGTATTTAAAAGAAGAAGAAAAAAAAAATTCAAAAAACAAAAGTATGAAAACTATTTCAAGTTTTCAACACCTCGAAAGCATTTGAACGTTAGAGTACAACCCCTTAAAGCAGCGTGGCCTTAACGTATTTCAGTTGCCGCTTAACGATTCAGGGTAAGAACCTAAAGAAGCCTCCAGAAACACGCAGAAAAGCACGCAGTGAGAGTGAAACGGGATGGAGAGATACCAGAGGGTGGTGAAGCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005718
ATGGAGAGATACCAGAGGGTGGTGAAGCCCAAACCGGAGCAACCCGTTAACGAAAATGAAATCCGAGTCACAGCTCAGGGTCTCATTCGCAATTACGTCACTTACGCTACTTCCTTGTTCCAGGACAAGAACGAGAAGGAGATTGTGCTGAAGGCGATGGGGCAGGCTATTAGTAAGGCTGTGGCTGTAGGAGAGATTATCAAGAAGAGAATCCCTGGATTACATCAAAATATATCAACTAGCTCTACAACTATAACTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788750.1
MERYQRVVKPKPEQPVNENEIRVTAQGLIRNYVTYATSLFQDKNEKEIVLKAMGQAISKAVAVGEIIKKRIPGLHQNISTSSTTITDAYEPIEEGLNLLEMKRQVSLISIALSTLELNKTSPGYQAPTVMREEGEKQQEQENKQSIISSTDIDEDNVGGRLQGRGGGRNRGRGRGRGRGRGMGWYGDYQENSGYYYWGARGERGGGGGGGGSWGYRGAGYERGRGRGRGYSYDGGRGWGYGYGSERGRGYGYGGGRGRGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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